Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTD2Q9H8S5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTD2Q9H8S5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTD2Q9H8S5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTD2Q9H8S5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTD2Q9H8S5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTD2Q9H8S5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD2Q9H8S5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD2Q9H8S5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTD2Q9H8S5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTD2Q9H8S5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTD2Q9H8S5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD2Q9H8S5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD2Q9H8S5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD2Q9H8S5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTD2Q9H8S5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD2Q9H8S5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTD2Q9H8S5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTD2Q9H8S5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTD2Q9H8S5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTD2Q9H8S5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTD2Q9H8S5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTD2Q9H8S5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTD2Q9H8S5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD2Q9H8S5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTD2Q9H8S5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTD2Q9H8S5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTD2Q9H8S5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTD2Q9H8S5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTD2Q9H8S5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTD2Q9H8S5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTD2Q9H8S5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD2Q9H8S5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD2Q9H8S5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD2Q9H8S5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD2Q9H8S5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD2Q9H8S5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD2Q9H8S5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTD2Q9H8S5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms