Protein–RNA interactions for Protein: Q99832

CCT7, T-complex protein 1 subunit eta, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT7Q99832 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCT7Q99832 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCT7Q99832 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCT7Q99832 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT7Q99832 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT7Q99832 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT7Q99832 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCT7Q99832 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCT7Q99832 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT7Q99832 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT7Q99832 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT7Q99832 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT7Q99832 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT7Q99832 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT7Q99832 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT7Q99832 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT7Q99832 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCT7Q99832 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT7Q99832 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT7Q99832 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT7Q99832 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCT7Q99832 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCT7Q99832 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCT7Q99832 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCT7Q99832 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCT7Q99832 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCT7Q99832 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCT7Q99832 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCT7Q99832 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT7Q99832 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCT7Q99832 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCT7Q99832 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms