Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX18Q96RF0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX18Q96RF0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX18Q96RF0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX18Q96RF0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX18Q96RF0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX18Q96RF0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX18Q96RF0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX18Q96RF0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX18Q96RF0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX18Q96RF0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX18Q96RF0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX18Q96RF0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX18Q96RF0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX18Q96RF0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX18Q96RF0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX18Q96RF0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX18Q96RF0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX18Q96RF0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX18Q96RF0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX18Q96RF0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX18Q96RF0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX18Q96RF0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX18Q96RF0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX18Q96RF0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX18Q96RF0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX18Q96RF0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX18Q96RF0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX18Q96RF0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX18Q96RF0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX18Q96RF0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX18Q96RF0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX18Q96RF0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX18Q96RF0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX18Q96RF0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX18Q96RF0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX18Q96RF0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX18Q96RF0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX18Q96RF0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX18Q96RF0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX18Q96RF0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX18Q96RF0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX18Q96RF0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX18Q96RF0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX18Q96RF0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX18Q96RF0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX18Q96RF0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX18Q96RF0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX18Q96RF0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX18Q96RF0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX18Q96RF0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX18Q96RF0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX18Q96RF0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX18Q96RF0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX18Q96RF0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX18Q96RF0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms