RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473312.5

AGAP3-211, Transcript of ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AGAP3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3-211ENST00000473312 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.62■■■■■ 6.97
AGAP3-211ENST00000473312 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.54■■■■■ 5.68
AGAP3-211ENST00000473312 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.48■■■■■ 5.51
AGAP3-211ENST00000473312 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.63■■■■■ 5.38
AGAP3-211ENST00000473312 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.47■■■■■ 5.35
AGAP3-211ENST00000473312 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.05■■■■■ 5.28
AGAP3-211ENST00000473312 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.47■■■■■ 5.19
AGAP3-211ENST00000473312 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
AGAP3-211ENST00000473312 ABCC9O60706 1549 aa46.85■■■■■ 5.09
AGAP3-211ENST00000473312 NACADO15069 1562 aa46.84■■■■■ 5.09
AGAP3-211ENST00000473312 SCRIBQ14160 1630 aa46.67■■■■■ 5.06
AGAP3-211ENST00000473312 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.16■■■■■ 4.98
AGAP3-211ENST00000473312 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.94■■■■■ 4.95
AGAP3-211ENST00000473312 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.94■■■■■ 4.94
AGAP3-211ENST00000473312 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.49■■■■■ 4.87
AGAP3-211ENST00000473312 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.35■■■■■ 4.85
AGAP3-211ENST00000473312 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.27■■■■■ 4.84
AGAP3-211ENST00000473312 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.16■■■■■ 4.82
AGAP3-211ENST00000473312 WIZO95785 1651 aa45.02■■■■■ 4.8
AGAP3-211ENST00000473312 SMARCA4P51532 1647 aa44.81■■■■■ 4.76
AGAP3-211ENST00000473312 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.79■■■■■ 4.76
AGAP3-211ENST00000473312 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
AGAP3-211ENST00000473312 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.43■■■■■ 4.7
AGAP3-211ENST00000473312 TRIM41Q8WV44 630 aa44.43■■■■■ 4.7
AGAP3-211ENST00000473312 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.69
AGAP3-211ENST00000473312 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.23■■■■■ 4.67
AGAP3-211ENST00000473312 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.22■■■■■ 4.67
AGAP3-211ENST00000473312 SMARCA2P51531 1590 aa44.21■■■■■ 4.67
AGAP3-211ENST00000473312 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.17■■■■■ 4.66
AGAP3-211ENST00000473312 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.82■■■■■ 4.61
AGAP3-211ENST00000473312 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
AGAP3-211ENST00000473312 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
AGAP3-211ENST00000473312 ABCC8Q09428 1581 aa43.59■■■■■ 4.57
AGAP3-211ENST00000473312 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.37■■■■■ 4.53
AGAP3-211ENST00000473312 HMGXB3Q12766 1538 aa43.27■■■■■ 4.52
AGAP3-211ENST00000473312 NCAPD3P42695 1498 aa43.26■■■■■ 4.52
AGAP3-211ENST00000473312 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.19■■■■■ 4.53e-6■■■■□ 25.8
AGAP3-211ENST00000473312 EEA1Q15075 1411 aa43.17■■■■■ 4.5
AGAP3-211ENST00000473312 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
AGAP3-211ENST00000473312 HRCP23327 699 aa43.07■■■■■ 4.49
AGAP3-211ENST00000473312 SOGA1O94964 1423 aa43.02■■■■■ 4.48
AGAP3-211ENST00000473312 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.98■■■■■ 4.47
AGAP3-211ENST00000473312 SYNJ1O43426 1573 aa42.96■■■■■ 4.47
AGAP3-211ENST00000473312 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.83■■■■■ 4.45
AGAP3-211ENST00000473312 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.8■■■■■ 4.44
AGAP3-211ENST00000473312 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.73■■■■■ 4.43
AGAP3-211ENST00000473312 TOP2BQ02880 1626 aa42.69■■■■■ 4.42
AGAP3-211ENST00000473312 GOLGA3Q08378 1498 aa42.62■■■■■ 4.41
AGAP3-211ENST00000473312 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.62■■■■■ 4.41
AGAP3-211ENST00000473312 CFTRP13569 1480 aa42.61■■■■■ 4.41
AGAP3-211ENST00000473312 CEP162Q5TB80 1403 aa42.56■■■■■ 4.4
AGAP3-211ENST00000473312 KIF21BO75037 1637 aa42.53■■■■■ 4.4
AGAP3-211ENST00000473312 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.5■■■■■ 4.39
AGAP3-211ENST00000473312 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.41■■■■■ 4.38
AGAP3-211ENST00000473312 PRDM2Q13029 1718 aa42.39■■■■■ 4.38
AGAP3-211ENST00000473312 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
AGAP3-211ENST00000473312 CUX1P39880 1505 aa42.33■■■■■ 4.37
AGAP3-211ENST00000473312 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.23■■■■■ 4.35
AGAP3-211ENST00000473312 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.09■■■■■ 4.33
AGAP3-211ENST00000473312 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.04■■■■■ 4.32
AGAP3-211ENST00000473312 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
AGAP3-211ENST00000473312 PRXQ9BXM0 1461 aa42.02■■■■■ 4.32
AGAP3-211ENST00000473312 KIF27Q86VH2 1401 aa41.99■■■■■ 4.31
AGAP3-211ENST00000473312 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
AGAP3-211ENST00000473312 CLIP1P30622 1438 aa41.97■■■■■ 4.31
AGAP3-211ENST00000473312 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.78■■■■■ 4.28
AGAP3-211ENST00000473312 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.76■■■■■ 4.28
AGAP3-211ENST00000473312 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.68■■■■■ 4.26
AGAP3-211ENST00000473312 CUX2O14529 1486 aa41.63■■■■■ 4.25
AGAP3-211ENST00000473312 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.58■■■■■ 4.25
AGAP3-211ENST00000473312 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.57■■■■■ 4.24
AGAP3-211ENST00000473312 IGF1RP08069 1367 aa41.53■■■■■ 4.24
AGAP3-211ENST00000473312 NESP48681 1621 aa41.49■■■■■ 4.23
AGAP3-211ENST00000473312 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
AGAP3-211ENST00000473312 TOPBP1Q92547 1522 aa41.44■■■■■ 4.22
AGAP3-211ENST00000473312 ARAP1Q96P48 1450 aa41.43■■■■■ 4.22
AGAP3-211ENST00000473312 APLP2Q06481 763 aa41.36■■■■■ 4.21
AGAP3-211ENST00000473312 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.35■■■■■ 4.21
AGAP3-211ENST00000473312 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.33■■■■■ 4.21
AGAP3-211ENST00000473312 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
AGAP3-211ENST00000473312 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
AGAP3-211ENST00000473312 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.23■■■■■ 4.19
AGAP3-211ENST00000473312 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.22■■■■■ 4.19
AGAP3-211ENST00000473312 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
AGAP3-211ENST00000473312 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.21■■■■■ 4.19
AGAP3-211ENST00000473312 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
AGAP3-211ENST00000473312 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
AGAP3-211ENST00000473312 WDR97A6NE52 1622 aa41.08■■■■■ 4.17
AGAP3-211ENST00000473312 CUL7Q14999 1698 aa41.06■■■■■ 4.16
AGAP3-211ENST00000473312 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.05■■■■■ 4.16
AGAP3-211ENST00000473312 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.96■■■■■ 4.15
AGAP3-211ENST00000473312 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.9■■■■■ 4.14
AGAP3-211ENST00000473312 MAP3K1Q13233 1512 aa40.87■■■■■ 4.13
AGAP3-211ENST00000473312 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
AGAP3-211ENST00000473312 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
AGAP3-211ENST00000473312 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.76■■■■■ 4.12
AGAP3-211ENST00000473312 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.76■■■■■ 4.12
AGAP3-211ENST00000473312 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.75■■■■■ 4.11
AGAP3-211ENST00000473312 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.75■■■■■ 4.11
AGAP3-211ENST00000473312 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
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