Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX18Q96RF0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX18Q96RF0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SNX18Q96RF0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SNX18Q96RF0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNX18Q96RF0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX18Q96RF0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX18Q96RF0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX18Q96RF0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNX18Q96RF0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX18Q96RF0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX18Q96RF0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX18Q96RF0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX18Q96RF0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX18Q96RF0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX18Q96RF0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX18Q96RF0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX18Q96RF0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX18Q96RF0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX18Q96RF0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX18Q96RF0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX18Q96RF0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX18Q96RF0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX18Q96RF0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX18Q96RF0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SNX18Q96RF0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX18Q96RF0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX18Q96RF0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SNX18Q96RF0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX18Q96RF0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX18Q96RF0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX18Q96RF0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX18Q96RF0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX18Q96RF0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX18Q96RF0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNX18Q96RF0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX18Q96RF0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX18Q96RF0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX18Q96RF0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX18Q96RF0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX18Q96RF0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX18Q96RF0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX18Q96RF0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX18Q96RF0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX18Q96RF0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX18Q96RF0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX18Q96RF0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX18Q96RF0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX18Q96RF0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX18Q96RF0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX18Q96RF0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX18Q96RF0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX18Q96RF0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX18Q96RF0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX18Q96RF0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX18Q96RF0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX18Q96RF0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX18Q96RF0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX18Q96RF0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX18Q96RF0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX18Q96RF0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX18Q96RF0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX18Q96RF0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX18Q96RF0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX18Q96RF0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX18Q96RF0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX18Q96RF0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX18Q96RF0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX18Q96RF0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX18Q96RF0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX18Q96RF0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX18Q96RF0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX18Q96RF0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX18Q96RF0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX18Q96RF0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX18Q96RF0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX18Q96RF0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX18Q96RF0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX18Q96RF0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX18Q96RF0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX18Q96RF0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX18Q96RF0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX18Q96RF0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX18Q96RF0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX18Q96RF0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX18Q96RF0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX18Q96RF0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX18Q96RF0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX18Q96RF0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX18Q96RF0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX18Q96RF0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX18Q96RF0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX18Q96RF0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX18Q96RF0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX18Q96RF0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX18Q96RF0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX18Q96RF0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX18Q96RF0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX18Q96RF0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX18Q96RF0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms