Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALR3Q96L12 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALR3Q96L12 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALR3Q96L12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALR3Q96L12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALR3Q96L12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALR3Q96L12 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALR3Q96L12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALR3Q96L12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALR3Q96L12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALR3Q96L12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALR3Q96L12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALR3Q96L12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALR3Q96L12 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALR3Q96L12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CALR3Q96L12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CALR3Q96L12 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALR3Q96L12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CALR3Q96L12 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALR3Q96L12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALR3Q96L12 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CALR3Q96L12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALR3Q96L12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALR3Q96L12 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALR3Q96L12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALR3Q96L12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALR3Q96L12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CALR3Q96L12 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CALR3Q96L12 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALR3Q96L12 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALR3Q96L12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CALR3Q96L12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALR3Q96L12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALR3Q96L12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALR3Q96L12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALR3Q96L12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALR3Q96L12 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALR3Q96L12 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALR3Q96L12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALR3Q96L12 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALR3Q96L12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALR3Q96L12 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALR3Q96L12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALR3Q96L12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALR3Q96L12 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALR3Q96L12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALR3Q96L12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALR3Q96L12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALR3Q96L12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALR3Q96L12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms