Protein–RNA interactions for Protein: Q96HZ4

HES6, Transcription cofactor HES-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES6Q96HZ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HES6Q96HZ4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HES6Q96HZ4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HES6Q96HZ4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HES6Q96HZ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HES6Q96HZ4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HES6Q96HZ4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HES6Q96HZ4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HES6Q96HZ4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HES6Q96HZ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HES6Q96HZ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HES6Q96HZ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HES6Q96HZ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HES6Q96HZ4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HES6Q96HZ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HES6Q96HZ4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HES6Q96HZ4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HES6Q96HZ4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HES6Q96HZ4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HES6Q96HZ4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HES6Q96HZ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HES6Q96HZ4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HES6Q96HZ4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HES6Q96HZ4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HES6Q96HZ4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HES6Q96HZ4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HES6Q96HZ4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HES6Q96HZ4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HES6Q96HZ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HES6Q96HZ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HES6Q96HZ4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HES6Q96HZ4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HES6Q96HZ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HES6Q96HZ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HES6Q96HZ4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HES6Q96HZ4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HES6Q96HZ4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HES6Q96HZ4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HES6Q96HZ4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HES6Q96HZ4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HES6Q96HZ4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HES6Q96HZ4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HES6Q96HZ4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HES6Q96HZ4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HES6Q96HZ4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HES6Q96HZ4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HES6Q96HZ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HES6Q96HZ4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HES6Q96HZ4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HES6Q96HZ4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HES6Q96HZ4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HES6Q96HZ4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HES6Q96HZ4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HES6Q96HZ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HES6Q96HZ4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HES6Q96HZ4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HES6Q96HZ4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HES6Q96HZ4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HES6Q96HZ4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HES6Q96HZ4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms