Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP3

DNAAF1, Dynein assembly factor 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF1Q8NEP3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF1Q8NEP3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF1Q8NEP3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF1Q8NEP3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF1Q8NEP3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF1Q8NEP3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF1Q8NEP3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF1Q8NEP3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF1Q8NEP3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF1Q8NEP3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF1Q8NEP3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF1Q8NEP3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF1Q8NEP3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF1Q8NEP3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF1Q8NEP3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF1Q8NEP3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF1Q8NEP3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF1Q8NEP3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF1Q8NEP3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF1Q8NEP3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF1Q8NEP3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF1Q8NEP3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF1Q8NEP3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF1Q8NEP3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF1Q8NEP3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF1Q8NEP3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAAF1Q8NEP3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF1Q8NEP3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF1Q8NEP3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF1Q8NEP3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF1Q8NEP3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF1Q8NEP3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF1Q8NEP3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF1Q8NEP3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF1Q8NEP3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF1Q8NEP3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF1Q8NEP3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF1Q8NEP3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF1Q8NEP3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF1Q8NEP3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF1Q8NEP3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF1Q8NEP3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms