Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNX2Q8N448 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNX2Q8N448 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNX2Q8N448 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LNX2Q8N448 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LNX2Q8N448 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNX2Q8N448 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNX2Q8N448 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LNX2Q8N448 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LNX2Q8N448 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LNX2Q8N448 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LNX2Q8N448 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LNX2Q8N448 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LNX2Q8N448 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LNX2Q8N448 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LNX2Q8N448 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LNX2Q8N448 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms