Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4F2

FDX2, Ferredoxin-2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDX2Q6P4F2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FDX2Q6P4F2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FDX2Q6P4F2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FDX2Q6P4F2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FDX2Q6P4F2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FDX2Q6P4F2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDX2Q6P4F2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FDX2Q6P4F2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FDX2Q6P4F2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FDX2Q6P4F2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDX2Q6P4F2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
FDX2Q6P4F2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FDX2Q6P4F2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDX2Q6P4F2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDX2Q6P4F2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDX2Q6P4F2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDX2Q6P4F2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDX2Q6P4F2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDX2Q6P4F2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDX2Q6P4F2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDX2Q6P4F2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDX2Q6P4F2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDX2Q6P4F2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDX2Q6P4F2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms