Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4F2

FDX2, Ferredoxin-2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDX2Q6P4F2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FDX2Q6P4F2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FDX2Q6P4F2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
FDX2Q6P4F2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FDX2Q6P4F2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FDX2Q6P4F2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FDX2Q6P4F2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FDX2Q6P4F2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FDX2Q6P4F2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FDX2Q6P4F2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FDX2Q6P4F2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FDX2Q6P4F2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FDX2Q6P4F2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FDX2Q6P4F2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FDX2Q6P4F2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FDX2Q6P4F2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FDX2Q6P4F2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FDX2Q6P4F2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FDX2Q6P4F2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FDX2Q6P4F2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FDX2Q6P4F2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FDX2Q6P4F2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FDX2Q6P4F2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FDX2Q6P4F2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FDX2Q6P4F2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FDX2Q6P4F2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FDX2Q6P4F2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FDX2Q6P4F2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FDX2Q6P4F2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FDX2Q6P4F2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FDX2Q6P4F2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FDX2Q6P4F2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FDX2Q6P4F2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FDX2Q6P4F2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FDX2Q6P4F2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FDX2Q6P4F2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FDX2Q6P4F2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FDX2Q6P4F2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FDX2Q6P4F2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FDX2Q6P4F2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FDX2Q6P4F2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FDX2Q6P4F2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FDX2Q6P4F2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FDX2Q6P4F2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FDX2Q6P4F2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FDX2Q6P4F2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FDX2Q6P4F2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FDX2Q6P4F2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FDX2Q6P4F2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FDX2Q6P4F2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FDX2Q6P4F2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FDX2Q6P4F2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FDX2Q6P4F2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FDX2Q6P4F2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDX2Q6P4F2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FDX2Q6P4F2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FDX2Q6P4F2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FDX2Q6P4F2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FDX2Q6P4F2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FDX2Q6P4F2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FDX2Q6P4F2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FDX2Q6P4F2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FDX2Q6P4F2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FDX2Q6P4F2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FDX2Q6P4F2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FDX2Q6P4F2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FDX2Q6P4F2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FDX2Q6P4F2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDX2Q6P4F2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDX2Q6P4F2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDX2Q6P4F2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FDX2Q6P4F2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FDX2Q6P4F2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FDX2Q6P4F2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDX2Q6P4F2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDX2Q6P4F2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDX2Q6P4F2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDX2Q6P4F2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDX2Q6P4F2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FDX2Q6P4F2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FDX2Q6P4F2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDX2Q6P4F2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDX2Q6P4F2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDX2Q6P4F2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FDX2Q6P4F2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FDX2Q6P4F2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FDX2Q6P4F2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FDX2Q6P4F2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FDX2Q6P4F2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FDX2Q6P4F2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FDX2Q6P4F2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FDX2Q6P4F2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FDX2Q6P4F2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FDX2Q6P4F2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FDX2Q6P4F2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FDX2Q6P4F2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FDX2Q6P4F2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FDX2Q6P4F2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FDX2Q6P4F2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FDX2Q6P4F2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.3 ms