Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A4Q6P1M0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A4Q6P1M0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A4Q6P1M0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A4Q6P1M0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A4Q6P1M0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A4Q6P1M0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A4Q6P1M0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A4Q6P1M0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A4Q6P1M0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A4Q6P1M0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A4Q6P1M0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A4Q6P1M0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A4Q6P1M0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A4Q6P1M0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A4Q6P1M0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A4Q6P1M0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A4Q6P1M0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A4Q6P1M0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A4Q6P1M0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A4Q6P1M0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A4Q6P1M0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A4Q6P1M0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A4Q6P1M0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A4Q6P1M0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A4Q6P1M0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A4Q6P1M0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A4Q6P1M0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms