Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCN1P1Q5VSP4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCN1P1Q5VSP4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCN1P1Q5VSP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN1P1Q5VSP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCN1P1Q5VSP4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCN1P1Q5VSP4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCN1P1Q5VSP4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCN1P1Q5VSP4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCN1P1Q5VSP4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCN1P1Q5VSP4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCN1P1Q5VSP4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCN1P1Q5VSP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCN1P1Q5VSP4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCN1P1Q5VSP4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCN1P1Q5VSP4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCN1P1Q5VSP4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN1P1Q5VSP4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN1P1Q5VSP4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN1P1Q5VSP4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN1P1Q5VSP4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LCN1P1Q5VSP4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN1P1Q5VSP4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCN1P1Q5VSP4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN1P1Q5VSP4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCN1P1Q5VSP4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCN1P1Q5VSP4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCN1P1Q5VSP4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN1P1Q5VSP4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN1P1Q5VSP4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN1P1Q5VSP4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCN1P1Q5VSP4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LCN1P1Q5VSP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCN1P1Q5VSP4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCN1P1Q5VSP4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN1P1Q5VSP4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN1P1Q5VSP4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN1P1Q5VSP4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN1P1Q5VSP4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN1P1Q5VSP4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN1P1Q5VSP4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LCN1P1Q5VSP4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN1P1Q5VSP4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms