Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC122Q5T0U0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC122Q5T0U0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC122Q5T0U0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC122Q5T0U0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC122Q5T0U0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC122Q5T0U0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC122Q5T0U0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC122Q5T0U0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC122Q5T0U0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC122Q5T0U0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC122Q5T0U0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC122Q5T0U0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC122Q5T0U0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC122Q5T0U0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC122Q5T0U0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC122Q5T0U0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC122Q5T0U0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC122Q5T0U0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC122Q5T0U0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC122Q5T0U0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC122Q5T0U0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC122Q5T0U0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC122Q5T0U0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC122Q5T0U0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC122Q5T0U0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC122Q5T0U0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC122Q5T0U0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC122Q5T0U0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC122Q5T0U0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC122Q5T0U0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC122Q5T0U0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC122Q5T0U0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC122Q5T0U0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC122Q5T0U0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.08■■■□□ 2.24
CCDC122Q5T0U0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC122Q5T0U0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC122Q5T0U0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC122Q5T0U0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC122Q5T0U0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC122Q5T0U0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC122Q5T0U0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC122Q5T0U0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC122Q5T0U0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC122Q5T0U0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC122Q5T0U0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC122Q5T0U0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC122Q5T0U0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC122Q5T0U0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC122Q5T0U0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC122Q5T0U0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC122Q5T0U0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC122Q5T0U0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC122Q5T0U0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC122Q5T0U0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC122Q5T0U0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC122Q5T0U0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC122Q5T0U0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC122Q5T0U0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC122Q5T0U0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC122Q5T0U0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC122Q5T0U0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC122Q5T0U0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC122Q5T0U0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC122Q5T0U0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC122Q5T0U0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC122Q5T0U0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC122Q5T0U0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC122Q5T0U0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC122Q5T0U0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC122Q5T0U0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC122Q5T0U0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC122Q5T0U0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms