Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCLAFQ15004 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCLAFQ15004 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCLAFQ15004 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCLAFQ15004 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCLAFQ15004 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCLAFQ15004 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCLAFQ15004 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCLAFQ15004 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PCLAFQ15004 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCLAFQ15004 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCLAFQ15004 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCLAFQ15004 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCLAFQ15004 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCLAFQ15004 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCLAFQ15004 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCLAFQ15004 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCLAFQ15004 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCLAFQ15004 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCLAFQ15004 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCLAFQ15004 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCLAFQ15004 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCLAFQ15004 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCLAFQ15004 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCLAFQ15004 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCLAFQ15004 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCLAFQ15004 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCLAFQ15004 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCLAFQ15004 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCLAFQ15004 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCLAFQ15004 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCLAFQ15004 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCLAFQ15004 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCLAFQ15004 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCLAFQ15004 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCLAFQ15004 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCLAFQ15004 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCLAFQ15004 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCLAFQ15004 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCLAFQ15004 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCLAFQ15004 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCLAFQ15004 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCLAFQ15004 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCLAFQ15004 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCLAFQ15004 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCLAFQ15004 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCLAFQ15004 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCLAFQ15004 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCLAFQ15004 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCLAFQ15004 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCLAFQ15004 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCLAFQ15004 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PCLAFQ15004 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCLAFQ15004 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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