Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCAPHQ15003 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCAPHQ15003 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCAPHQ15003 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCAPHQ15003 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCAPHQ15003 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCAPHQ15003 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCAPHQ15003 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NCAPHQ15003 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCAPHQ15003 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCAPHQ15003 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCAPHQ15003 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NCAPHQ15003 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCAPHQ15003 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCAPHQ15003 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCAPHQ15003 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCAPHQ15003 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCAPHQ15003 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NCAPHQ15003 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPHQ15003 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCAPHQ15003 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCAPHQ15003 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCAPHQ15003 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCAPHQ15003 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPHQ15003 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NCAPHQ15003 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NCAPHQ15003 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NCAPHQ15003 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPHQ15003 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NCAPHQ15003 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPHQ15003 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPHQ15003 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCAPHQ15003 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCAPHQ15003 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCAPHQ15003 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCAPHQ15003 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCAPHQ15003 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCAPHQ15003 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NCAPHQ15003 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCAPHQ15003 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCAPHQ15003 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPHQ15003 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPHQ15003 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPHQ15003 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPHQ15003 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPHQ15003 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPHQ15003 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPHQ15003 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NCAPHQ15003 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCAPHQ15003 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCAPHQ15003 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCAPHQ15003 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCAPHQ15003 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCAPHQ15003 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCAPHQ15003 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCAPHQ15003 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCAPHQ15003 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCAPHQ15003 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NCAPHQ15003 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCAPHQ15003 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCAPHQ15003 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCAPHQ15003 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
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