Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EFNB1P98172 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFNB1P98172 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFNB1P98172 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFNB1P98172 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFNB1P98172 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFNB1P98172 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFNB1P98172 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFNB1P98172 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNB1P98172 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNB1P98172 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFNB1P98172 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNB1P98172 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNB1P98172 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNB1P98172 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNB1P98172 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNB1P98172 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFNB1P98172 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFNB1P98172 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFNB1P98172 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EFNB1P98172 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFNB1P98172 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNB1P98172 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNB1P98172 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFNB1P98172 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFNB1P98172 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFNB1P98172 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFNB1P98172 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFNB1P98172 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFNB1P98172 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFNB1P98172 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms