Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EFNB1P98172 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EFNB1P98172 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
EFNB1P98172 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EFNB1P98172 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EFNB1P98172 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
EFNB1P98172 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EFNB1P98172 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EFNB1P98172 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EFNB1P98172 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFNB1P98172 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EFNB1P98172 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EFNB1P98172 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EFNB1P98172 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFNB1P98172 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFNB1P98172 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EFNB1P98172 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EFNB1P98172 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EFNB1P98172 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFNB1P98172 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EFNB1P98172 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFNB1P98172 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFNB1P98172 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFNB1P98172 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFNB1P98172 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFNB1P98172 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFNB1P98172 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFNB1P98172 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFNB1P98172 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EFNB1P98172 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EFNB1P98172 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EFNB1P98172 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EFNB1P98172 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EFNB1P98172 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EFNB1P98172 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EFNB1P98172 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EFNB1P98172 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFNB1P98172 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EFNB1P98172 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EFNB1P98172 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFNB1P98172 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFNB1P98172 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFNB1P98172 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFNB1P98172 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFNB1P98172 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFNB1P98172 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EFNB1P98172 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFNB1P98172 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFNB1P98172 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFNB1P98172 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFNB1P98172 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFNB1P98172 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFNB1P98172 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EFNB1P98172 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EFNB1P98172 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EFNB1P98172 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EFNB1P98172 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EFNB1P98172 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EFNB1P98172 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EFNB1P98172 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFNB1P98172 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFNB1P98172 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFNB1P98172 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFNB1P98172 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFNB1P98172 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFNB1P98172 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EFNB1P98172 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EFNB1P98172 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFNB1P98172 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFNB1P98172 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFNB1P98172 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFNB1P98172 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFNB1P98172 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFNB1P98172 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFNB1P98172 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFNB1P98172 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFNB1P98172 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFNB1P98172 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFNB1P98172 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFNB1P98172 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFNB1P98172 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFNB1P98172 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFNB1P98172 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFNB1P98172 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFNB1P98172 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFNB1P98172 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFNB1P98172 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFNB1P98172 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFNB1P98172 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFNB1P98172 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFNB1P98172 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFNB1P98172 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EFNB1P98172 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EFNB1P98172 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFNB1P98172 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFNB1P98172 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EFNB1P98172 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EFNB1P98172 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EFNB1P98172 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFNB1P98172 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms