Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VLDLRP98155 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VLDLRP98155 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VLDLRP98155 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VLDLRP98155 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VLDLRP98155 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VLDLRP98155 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VLDLRP98155 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VLDLRP98155 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VLDLRP98155 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VLDLRP98155 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VLDLRP98155 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VLDLRP98155 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VLDLRP98155 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VLDLRP98155 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VLDLRP98155 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VLDLRP98155 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VLDLRP98155 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VLDLRP98155 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VLDLRP98155 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VLDLRP98155 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VLDLRP98155 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VLDLRP98155 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VLDLRP98155 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VLDLRP98155 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VLDLRP98155 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VLDLRP98155 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VLDLRP98155 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VLDLRP98155 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VLDLRP98155 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VLDLRP98155 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VLDLRP98155 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VLDLRP98155 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VLDLRP98155 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VLDLRP98155 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VLDLRP98155 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VLDLRP98155 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VLDLRP98155 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VLDLRP98155 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VLDLRP98155 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VLDLRP98155 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VLDLRP98155 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VLDLRP98155 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VLDLRP98155 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VLDLRP98155 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms