Protein–RNA interactions for Protein: P12643

BMP2, Bone morphogenetic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP2P12643 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP2P12643 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BMP2P12643 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BMP2P12643 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP2P12643 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BMP2P12643 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BMP2P12643 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BMP2P12643 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP2P12643 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP2P12643 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP2P12643 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP2P12643 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP2P12643 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP2P12643 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
BMP2P12643 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP2P12643 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP2P12643 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP2P12643 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP2P12643 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BMP2P12643 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP2P12643 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP2P12643 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BMP2P12643 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BMP2P12643 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BMP2P12643 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BMP2P12643 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BMP2P12643 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP2P12643 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP2P12643 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP2P12643 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BMP2P12643 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP2P12643 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP2P12643 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BMP2P12643 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BMP2P12643 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP2P12643 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP2P12643 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMP2P12643 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMP2P12643 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMP2P12643 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP2P12643 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BMP2P12643 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMP2P12643 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMP2P12643 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP2P12643 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP2P12643 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP2P12643 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP2P12643 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP2P12643 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP2P12643 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP2P12643 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP2P12643 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMP2P12643 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BMP2P12643 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP2P12643 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP2P12643 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP2P12643 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP2P12643 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP2P12643 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMP2P12643 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMP2P12643 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BMP2P12643 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BMP2P12643 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP2P12643 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP2P12643 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP2P12643 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP2P12643 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP2P12643 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP2P12643 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP2P12643 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP2P12643 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP2P12643 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP2P12643 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMP2P12643 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMP2P12643 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMP2P12643 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMP2P12643 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMP2P12643 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BMP2P12643 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BMP2P12643 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP2P12643 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMP2P12643 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMP2P12643 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BMP2P12643 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BMP2P12643 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BMP2P12643 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BMP2P12643 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BMP2P12643 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP2P12643 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP2P12643 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP2P12643 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP2P12643 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP2P12643 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP2P12643 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP2P12643 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP2P12643 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP2P12643 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP2P12643 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP2P12643 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP2P12643 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms