RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579527.5

TSPOAP1-AS1-203, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,042 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.07■■■■■ 6.41
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.45■■■■■ 5.19
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.51■■■■■ 5.04
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.89■■■■■ 4.94
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.47■■■■■ 4.87
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.17■■■■■ 4.82
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.46■■■■■ 4.71
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SCRIBQ14160 1630 aa43.91■■■■■ 4.62
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ABCC9O60706 1549 aa43.89■■■■■ 4.62
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NACADO15069 1562 aa43.89■■■■■ 4.62
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.38■■■■■ 4.54
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.25■■■■■ 4.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.76■■■■■ 4.44
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.65■■■■■ 4.42
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.59■■■■■ 4.41
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 WIZO95785 1651 aa42.42■■■■■ 4.38
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SMARCA4P51532 1647 aa42.12■■■■■ 4.33
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BICRAQ9NZM4 1560 aa42■■■■■ 4.31
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TRIM41Q8WV44 630 aa41.89■■■■■ 4.3
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.83■■■■■ 4.29
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.64■■■■■ 4.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SMARCA2P51531 1590 aa41.6■■■■■ 4.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.53■■■■■ 4.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.5■■■■■ 4.23
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.38■■■■■ 4.21
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HRCP23327 699 aa41.34■■■■■ 4.21
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ABCC8Q09428 1581 aa41.11■■■■■ 4.17
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.1■■■■■ 4.17
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.67■■■■■ 4.1
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.61■■■■■ 4.09
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 EEA1Q15075 1411 aa40.61■■■■■ 4.09
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HMGXB3Q12766 1538 aa40.57■■■■■ 4.08
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SOGA1O94964 1423 aa40.55■■■■■ 4.08
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NCAPD3P42695 1498 aa40.5■■■■■ 4.07
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SYNJ1O43426 1573 aa40.47■■■■■ 4.07
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.35■■■■■ 4.05
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.31■■■■■ 4.04
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.24■■■■■ 4.03
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TOP2BQ02880 1626 aa40.17■■■■■ 4.02
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CEP162Q5TB80 1403 aa40.16■■■■■ 4.02
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GOLGA3Q08378 1498 aa40.16■■■■■ 4.02
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.12■■■■■ 4.01
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KIF21BO75037 1637 aa40.09■■■■■ 4.01
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.02■■■■■ 4
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CFTRP13569 1480 aa39.96■■■■□ 3.99
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PRDM2Q13029 1718 aa39.92■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CUX1P39880 1505 aa39.79■■■■□ 3.96
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.74■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.66■■■■□ 3.94
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.58■■■■□ 3.93
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CLIP1P30622 1438 aa39.56■■■■□ 3.92
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.56■■■■□ 3.92
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PRXQ9BXM0 1461 aa39.51■■■■□ 3.92
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KIF27Q86VH2 1401 aa39.46■■■■□ 3.91
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.38■■■■□ 3.9
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.17■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.16■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CUX2O14529 1486 aa39.13■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ARAP1Q96P48 1450 aa39.06■■■■□ 3.84
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.04■■■■□ 3.84
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.83
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 IGF1RP08069 1367 aa39■■■■□ 3.83
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 APLP2Q06481 763 aa38.99■■■■□ 3.83
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.96■■■■□ 3.83
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NESP48681 1621 aa38.93■■■■□ 3.82
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TOPBP1Q92547 1522 aa38.89■■■■□ 3.82
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.83■■■■□ 3.81
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.82■■■■□ 3.81
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.81■■■■□ 3.8
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.79■■■■□ 3.8
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.71■■■■□ 3.79
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 WDR97A6NE52 1622 aa38.64■■■■□ 3.78
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CUL7Q14999 1698 aa38.62■■■■□ 3.77
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.59■■■■□ 3.77
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.5■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MAP3K1Q13233 1512 aa38.46■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.44■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.42■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.42■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TIAM1Q13009 1591 aa38.39■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.34■■■■□ 3.73
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.34■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms