RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579527.5

TSPOAP1-AS1-203, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,042 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.07■■■■■ 6.41
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.46■■■■■ 4.71
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ABCC9O60706 1549 aa43.89■■■■■ 4.62
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.25■■■■■ 4.51
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.65■■■■■ 4.42
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.59■■■■■ 4.41
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BICRAQ9NZM4 1560 aa42■■■■■ 4.31
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.64■■■■■ 4.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SMARCA2P51531 1590 aa41.6■■■■■ 4.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.53■■■■■ 4.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.5■■■■■ 4.23
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SOGA1O94964 1423 aa40.55■■■■■ 4.08
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NCAPD3P42695 1498 aa40.5■■■■■ 4.07
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SYNJ1O43426 1573 aa40.47■■■■■ 4.07
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.35■■■■■ 4.05
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.31■■■■■ 4.04
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.24■■■■■ 4.03
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.66■■■■□ 3.94
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.82■■■■□ 3.81
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.5■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MAP3K1Q13233 1512 aa38.46■■■■□ 3.75
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.42■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.42■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TIAM1Q13009 1591 aa38.39■■■■□ 3.74
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