Protein–RNA interactions for Protein: P05231

IL6, Interleukin-6, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL6P05231 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IL6P05231 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
IL6P05231 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IL6P05231 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IL6P05231 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IL6P05231 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IL6P05231 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IL6P05231 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IL6P05231 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IL6P05231 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IL6P05231 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IL6P05231 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IL6P05231 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IL6P05231 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IL6P05231 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IL6P05231 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IL6P05231 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IL6P05231 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IL6P05231 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IL6P05231 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IL6P05231 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IL6P05231 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IL6P05231 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IL6P05231 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IL6P05231 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IL6P05231 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IL6P05231 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IL6P05231 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IL6P05231 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IL6P05231 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IL6P05231 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IL6P05231 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IL6P05231 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IL6P05231 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IL6P05231 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IL6P05231 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IL6P05231 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IL6P05231 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IL6P05231 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IL6P05231 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IL6P05231 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IL6P05231 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IL6P05231 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IL6P05231 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IL6P05231 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IL6P05231 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IL6P05231 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IL6P05231 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IL6P05231 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IL6P05231 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IL6P05231 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IL6P05231 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IL6P05231 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IL6P05231 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IL6P05231 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IL6P05231 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IL6P05231 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IL6P05231 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IL6P05231 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IL6P05231 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IL6P05231 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IL6P05231 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IL6P05231 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IL6P05231 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IL6P05231 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IL6P05231 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
IL6P05231 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IL6P05231 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IL6P05231 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IL6P05231 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IL6P05231 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IL6P05231 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IL6P05231 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IL6P05231 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IL6P05231 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IL6P05231 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IL6P05231 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IL6P05231 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IL6P05231 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IL6P05231 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IL6P05231 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IL6P05231 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IL6P05231 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IL6P05231 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IL6P05231 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IL6P05231 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IL6P05231 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IL6P05231 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IL6P05231 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IL6P05231 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IL6P05231 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IL6P05231 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IL6P05231 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IL6P05231 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IL6P05231 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IL6P05231 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IL6P05231 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IL6P05231 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IL6P05231 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IL6P05231 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms