Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4BO94953 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM4BO94953 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM4BO94953 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4BO94953 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4BO94953 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4BO94953 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4BO94953 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4BO94953 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4BO94953 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4BO94953 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4BO94953 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4BO94953 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM4BO94953 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4BO94953 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4BO94953 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4BO94953 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4BO94953 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4BO94953 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4BO94953 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM4BO94953 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM4BO94953 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM4BO94953 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM4BO94953 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM4BO94953 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM4BO94953 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4BO94953 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4BO94953 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms