Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA6L4A6NEF3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA6L4A6NEF3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA6L4A6NEF3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA6L4A6NEF3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA6L4A6NEF3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA6L4A6NEF3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA6L4A6NEF3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA6L4A6NEF3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA6L4A6NEF3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA6L4A6NEF3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA6L4A6NEF3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GOLGA6L4A6NEF3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GOLGA6L4A6NEF3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GOLGA6L4A6NEF3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GOLGA6L4A6NEF3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GOLGA6L4A6NEF3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GOLGA6L4A6NEF3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GOLGA6L4A6NEF3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GOLGA6L4A6NEF3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GOLGA6L4A6NEF3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GOLGA6L4A6NEF3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GOLGA6L4A6NEF3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA6L4A6NEF3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA6L4A6NEF3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA6L4A6NEF3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA6L4A6NEF3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GOLGA6L4A6NEF3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GOLGA6L4A6NEF3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA6L4A6NEF3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA6L4A6NEF3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA6L4A6NEF3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA6L4A6NEF3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA6L4A6NEF3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA6L4A6NEF3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA6L4A6NEF3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA6L4A6NEF3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA6L4A6NEF3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA6L4A6NEF3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA6L4A6NEF3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA6L4A6NEF3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GOLGA6L4A6NEF3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GOLGA6L4A6NEF3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA6L4A6NEF3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA6L4A6NEF3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA6L4A6NEF3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA6L4A6NEF3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA6L4A6NEF3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GOLGA6L4A6NEF3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA6L4A6NEF3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GOLGA6L4A6NEF3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA6L4A6NEF3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GOLGA6L4A6NEF3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA6L4A6NEF3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA6L4A6NEF3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA6L4A6NEF3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA6L4A6NEF3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA6L4A6NEF3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA6L4A6NEF3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA6L4A6NEF3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA6L4A6NEF3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA6L4A6NEF3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GOLGA6L4A6NEF3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA6L4A6NEF3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA6L4A6NEF3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA6L4A6NEF3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA6L4A6NEF3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA6L4A6NEF3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA6L4A6NEF3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA6L4A6NEF3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA6L4A6NEF3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA6L4A6NEF3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GOLGA6L4A6NEF3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA6L4A6NEF3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA6L4A6NEF3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA6L4A6NEF3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA6L4A6NEF3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GOLGA6L4A6NEF3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA6L4A6NEF3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GOLGA6L4A6NEF3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GOLGA6L4A6NEF3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GOLGA6L4A6NEF3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA6L4A6NEF3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA6L4A6NEF3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms