Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHM5

KDM2B, Lysine-specific demethylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2BQ8NHM5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM2BQ8NHM5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM2BQ8NHM5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM2BQ8NHM5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM2BQ8NHM5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM2BQ8NHM5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM2BQ8NHM5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM2BQ8NHM5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2BQ8NHM5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2BQ8NHM5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2BQ8NHM5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM2BQ8NHM5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM2BQ8NHM5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM2BQ8NHM5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
KDM2BQ8NHM5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM2BQ8NHM5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM2BQ8NHM5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM2BQ8NHM5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM2BQ8NHM5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM2BQ8NHM5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM2BQ8NHM5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2BQ8NHM5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2BQ8NHM5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2BQ8NHM5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2BQ8NHM5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM2BQ8NHM5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM2BQ8NHM5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM2BQ8NHM5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34■■■■□ 3.03
KDM2BQ8NHM5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM2BQ8NHM5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM2BQ8NHM5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM2BQ8NHM5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM2BQ8NHM5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM2BQ8NHM5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM2BQ8NHM5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM2BQ8NHM5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM2BQ8NHM5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM2BQ8NHM5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM2BQ8NHM5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM2BQ8NHM5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM2BQ8NHM5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM2BQ8NHM5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM2BQ8NHM5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM2BQ8NHM5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM2BQ8NHM5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
KDM2BQ8NHM5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM2BQ8NHM5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM2BQ8NHM5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM2BQ8NHM5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM2BQ8NHM5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM2BQ8NHM5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM2BQ8NHM5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM2BQ8NHM5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM2BQ8NHM5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM2BQ8NHM5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM2BQ8NHM5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM2BQ8NHM5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM2BQ8NHM5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM2BQ8NHM5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM2BQ8NHM5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM2BQ8NHM5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM2BQ8NHM5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM2BQ8NHM5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM2BQ8NHM5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms