RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581792.1

MIR3648-2-201, Transcript of microRNA 3648-2, humanhuman

BASIC

Gene MIR3648-2, Length 180 nt, Biotype miRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR3648-2-201ENST00000581792 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.67■■■■■ 7.78
MIR3648-2-201ENST00000581792 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.91■■■■■ 6.7
MIR3648-2-201ENST00000581792 ABCC9O60706 1549 aa56.51■■■■■ 6.64
MIR3648-2-201ENST00000581792 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.98■■■■■ 6.23
MIR3648-2-201ENST00000581792 NACADO15069 1562 aa53.74■■■■■ 6.19
MIR3648-2-201ENST00000581792 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.59■■■■■ 6.17
MIR3648-2-201ENST00000581792 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.16■■■■■ 6.1
MIR3648-2-201ENST00000581792 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.84■■■■■ 6.05
MIR3648-2-201ENST00000581792 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.76■■■■■ 6.04
MIR3648-2-201ENST00000581792 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.72■■■■■ 6.03
MIR3648-2-201ENST00000581792 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.68■■■■■ 6.02
MIR3648-2-201ENST00000581792 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.62■■■■■ 6.01
MIR3648-2-201ENST00000581792 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.4■■■■■ 5.98
MIR3648-2-201ENST00000581792 SCRIBQ14160 1630 aa51.88■■■■■ 5.9
MIR3648-2-201ENST00000581792 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.73■■■■■ 5.87
MIR3648-2-201ENST00000581792 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.08■■■■■ 5.77
MIR3648-2-201ENST00000581792 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.07■■■■■ 5.77
MIR3648-2-201ENST00000581792 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.87■■■■■ 5.73
MIR3648-2-201ENST00000581792 NCAPD3P42695 1498 aa49.63■■■■■ 5.53
MIR3648-2-201ENST00000581792 SMARCA4P51532 1647 aa49.56■■■■■ 5.52
MIR3648-2-201ENST00000581792 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.52■■■■■ 5.52
MIR3648-2-201ENST00000581792 SMARCA2P51531 1590 aa49.39■■■■■ 5.5
MIR3648-2-201ENST00000581792 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.38■■■■■ 5.5
MIR3648-2-201ENST00000581792 HMGXB3Q12766 1538 aa49.25■■■■■ 5.48
MIR3648-2-201ENST00000581792 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.09■■■■■ 5.45
MIR3648-2-201ENST00000581792 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.06■■■■■ 5.44
MIR3648-2-201ENST00000581792 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.05■■■■■ 5.44
MIR3648-2-201ENST00000581792 ERCC6Q03468 1493 aa48.75■■■■■ 5.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 NESP48681 1621 aa48.67■■■■■ 5.38
MIR3648-2-201ENST00000581792 CUX2O14529 1486 aa48.54■■■■■ 5.36
MIR3648-2-201ENST00000581792 WIZO95785 1651 aa48.48■■■■■ 5.35
MIR3648-2-201ENST00000581792 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.4■■■■■ 5.34
MIR3648-2-201ENST00000581792 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.22■■■■■ 5.31
MIR3648-2-201ENST00000581792 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.14■■■■■ 5.3
MIR3648-2-201ENST00000581792 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.14■■■■■ 5.3
MIR3648-2-201ENST00000581792 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.07■■■■■ 5.29
MIR3648-2-201ENST00000581792 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.07■■■■■ 5.29
MIR3648-2-201ENST00000581792 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.04■■■■■ 5.28
MIR3648-2-201ENST00000581792 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
MIR3648-2-201ENST00000581792 CFTRP13569 1480 aa47.67■■■■■ 5.22
MIR3648-2-201ENST00000581792 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.66■■■■■ 5.22
MIR3648-2-201ENST00000581792 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.56■■■■■ 5.2
MIR3648-2-201ENST00000581792 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.56■■■■■ 5.2
MIR3648-2-201ENST00000581792 WDR62O43379 1518 aa47.53■■■■■ 5.2
MIR3648-2-201ENST00000581792 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.39■■■■■ 5.18
MIR3648-2-201ENST00000581792 PRDM2Q13029 1718 aa47.19■■■■■ 5.15
MIR3648-2-201ENST00000581792 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.14■■■■■ 5.14
MIR3648-2-201ENST00000581792 TOPBP1Q92547 1522 aa46.71■■■■■ 5.07
MIR3648-2-201ENST00000581792 ABCC8Q09428 1581 aa46.67■■■■■ 5.06
MIR3648-2-201ENST00000581792 IFT140Q96RY7 1462 aa46.61■■■■■ 5.05
MIR3648-2-201ENST00000581792 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.56■■■■■ 5.04
MIR3648-2-201ENST00000581792 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
MIR3648-2-201ENST00000581792 OSCARQ8IYS5 282 aa46.45■■■■■ 5.03
MIR3648-2-201ENST00000581792 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.42■■■■■ 5.02
MIR3648-2-201ENST00000581792 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.26■■■■■ 5
MIR3648-2-201ENST00000581792 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
MIR3648-2-201ENST00000581792 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
MIR3648-2-201ENST00000581792 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.14■■■■■ 4.98
MIR3648-2-201ENST00000581792 TRIM41Q8WV44 630 aa46.1■■■■■ 4.97
MIR3648-2-201ENST00000581792 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.09■■■■■ 4.97
MIR3648-2-201ENST00000581792 SOGA1O94964 1423 aa46.09■■■■■ 4.97
MIR3648-2-201ENST00000581792 CUX1P39880 1505 aa46.06■■■■■ 4.96
MIR3648-2-201ENST00000581792 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.03■■■■■ 4.96
MIR3648-2-201ENST00000581792 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
MIR3648-2-201ENST00000581792 WDR97A6NE52 1622 aa45.82■■■■■ 4.93
MIR3648-2-201ENST00000581792 CHD1O14646 1710 aa45.8■■■■■ 4.92
MIR3648-2-201ENST00000581792 FBLN2P98095 1184 aa45.76■■■■■ 4.92
MIR3648-2-201ENST00000581792 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.72■■■■■ 4.91
MIR3648-2-201ENST00000581792 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.72■■■■■ 4.91
MIR3648-2-201ENST00000581792 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.72■■■■■ 4.91
MIR3648-2-201ENST00000581792 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.65■■■■■ 4.9
MIR3648-2-201ENST00000581792 ARHGEF11O15085 1522 aa45.63■■■■■ 4.9
MIR3648-2-201ENST00000581792 GRIN2BQ13224 1484 aa45.61■■■■■ 4.89
MIR3648-2-201ENST00000581792 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.57■■■■■ 4.89
MIR3648-2-201ENST00000581792 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.55■■■■■ 4.88
MIR3648-2-201ENST00000581792 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.53■■■■■ 4.88
MIR3648-2-201ENST00000581792 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.51■■■■■ 4.88
MIR3648-2-201ENST00000581792 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.46■■■■■ 4.87
MIR3648-2-201ENST00000581792 TOP2BQ02880 1626 aa45.44■■■■■ 4.86
MIR3648-2-201ENST00000581792 PBRM1Q86U86 1689 aa45.44■■■■■ 4.86
MIR3648-2-201ENST00000581792 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.43■■■■■ 4.86
MIR3648-2-201ENST00000581792 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.41■■■■■ 4.86
MIR3648-2-201ENST00000581792 SYNJ2O15056 1496 aa45.41■■■■■ 4.86
MIR3648-2-201ENST00000581792 SYNJ1O43426 1573 aa45.38■■■■■ 4.86
MIR3648-2-201ENST00000581792 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.33■■■■■ 4.85
MIR3648-2-201ENST00000581792 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.3■■■■■ 4.84
MIR3648-2-201ENST00000581792 ARAP1Q96P48 1450 aa45.21■■■■■ 4.83
MIR3648-2-201ENST00000581792 GRIN2AQ12879 1464 aa45.03■■■■■ 4.8
MIR3648-2-201ENST00000581792 ADAMTS12P58397 1594 aa45.03■■■■■ 4.8
MIR3648-2-201ENST00000581792 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.98■■■■■ 4.79
MIR3648-2-201ENST00000581792 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.96■■■■■ 4.79
MIR3648-2-201ENST00000581792 NUP160Q12769 1436 aa44.87■■■■■ 4.77
MIR3648-2-201ENST00000581792 CEP170Q5SW79 1584 aa44.82■■■■■ 4.77
MIR3648-2-201ENST00000581792 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
MIR3648-2-201ENST00000581792 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.64■■■■■ 4.74
MIR3648-2-201ENST00000581792 SHROOM2Q13796 1616 aa44.6■■■■■ 4.73
MIR3648-2-201ENST00000581792 KIF27Q86VH2 1401 aa44.59■■■■■ 4.73
MIR3648-2-201ENST00000581792 IGF1RP08069 1367 aa44.56■■■■■ 4.72
MIR3648-2-201ENST00000581792 JPH4Q96JJ6 628 aa44.46■■■■■ 4.71
MIR3648-2-201ENST00000581792 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms