RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393190.4

NME2-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME2, Length 866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2-202ENST00000393190 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.91■■■■■ 7.98
NME2-202ENST00000393190 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.94■■■■■ 6.87
NME2-202ENST00000393190 ABCC9O60706 1549 aa57.4■■■■■ 6.78
NME2-202ENST00000393190 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.85■■■■■ 6.37
NME2-202ENST00000393190 NACADO15069 1562 aa54.63■■■■■ 6.34
NME2-202ENST00000393190 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.51■■■■■ 6.32
NME2-202ENST00000393190 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.08■■■■■ 6.25
NME2-202ENST00000393190 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.92■■■■■ 6.22
NME2-202ENST00000393190 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.72■■■■■ 6.19
NME2-202ENST00000393190 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.63■■■■■ 6.18
NME2-202ENST00000393190 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.58■■■■■ 6.17
NME2-202ENST00000393190 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.4■■■■■ 6.14
NME2-202ENST00000393190 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.32■■■■■ 6.13
NME2-202ENST00000393190 SCRIBQ14160 1630 aa52.88■■■■■ 6.06
NME2-202ENST00000393190 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.53■■■■■ 6
NME2-202ENST00000393190 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.92■■■■■ 5.9
NME2-202ENST00000393190 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.89■■■■■ 5.9
NME2-202ENST00000393190 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.62■■■■■ 5.85
NME2-202ENST00000393190 SMARCA4P51532 1647 aa50.51■■■■■ 5.68
NME2-202ENST00000393190 NCAPD3P42695 1498 aa50.46■■■■■ 5.67
NME2-202ENST00000393190 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.41■■■■■ 5.66
NME2-202ENST00000393190 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.3■■■■■ 5.64
NME2-202ENST00000393190 SMARCA2P51531 1590 aa50.24■■■■■ 5.63
NME2-202ENST00000393190 HMGXB3Q12766 1538 aa50.11■■■■■ 5.61
NME2-202ENST00000393190 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.06■■■■■ 5.6
NME2-202ENST00000393190 PEG3Q9GZU2 1588 aa50■■■■■ 5.6
NME2-202ENST00000393190 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.91■■■■■ 5.58
NME2-202ENST00000393190 NESP48681 1621 aa49.52■■■■■ 5.52
NME2-202ENST00000393190 WIZO95785 1651 aa49.49■■■■■ 5.51
NME2-202ENST00000393190 ERCC6Q03468 1493 aa49.45■■■■■ 5.51
NME2-202ENST00000393190 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.24■■■■■ 5.47
NME2-202ENST00000393190 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.19■■■■■ 5.47
NME2-202ENST00000393190 CUX2O14529 1486 aa49.16■■■■■ 5.46
NME2-202ENST00000393190 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.95■■■■■ 5.43
NME2-202ENST00000393190 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.88■■■■■ 5.42
NME2-202ENST00000393190 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.88■■■■■ 5.42
NME2-202ENST00000393190 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.86■■■■■ 5.41
NME2-202ENST00000393190 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.86■■■■■ 5.41
NME2-202ENST00000393190 CFTRP13569 1480 aa48.53■■■■■ 5.36
NME2-202ENST00000393190 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.49■■■■■ 5.35
NME2-202ENST00000393190 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.44■■■■■ 5.35
NME2-202ENST00000393190 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.4■■■■■ 5.34
NME2-202ENST00000393190 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.36■■■■■ 5.33
NME2-202ENST00000393190 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.34■■■■■ 5.33
NME2-202ENST00000393190 WDR62O43379 1518 aa48.32■■■■■ 5.33
NME2-202ENST00000393190 PRDM2Q13029 1718 aa48.09■■■■■ 5.29
NME2-202ENST00000393190 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
NME2-202ENST00000393190 TOPBP1Q92547 1522 aa47.56■■■■■ 5.2
NME2-202ENST00000393190 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
NME2-202ENST00000393190 ABCC8Q09428 1581 aa47.43■■■■■ 5.18
NME2-202ENST00000393190 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.42■■■■■ 5.18
NME2-202ENST00000393190 IFT140Q96RY7 1462 aa47.37■■■■■ 5.17
NME2-202ENST00000393190 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.31■■■■■ 5.16
NME2-202ENST00000393190 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
NME2-202ENST00000393190 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
NME2-202ENST00000393190 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.04■■■■■ 5.12
NME2-202ENST00000393190 OSCARQ8IYS5 282 aa47.03■■■■■ 5.12
NME2-202ENST00000393190 CUX1P39880 1505 aa47■■■■■ 5.11
NME2-202ENST00000393190 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.96■■■■■ 5.11
NME2-202ENST00000393190 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.95■■■■■ 5.113e-7■■□□□ 14.3
NME2-202ENST00000393190 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.9■■■■■ 5.1
NME2-202ENST00000393190 SOGA1O94964 1423 aa46.9■■■■■ 5.1
NME2-202ENST00000393190 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.75■■■■■ 5.07
NME2-202ENST00000393190 TRIM41Q8WV44 630 aa46.62■■■■■ 5.05
NME2-202ENST00000393190 CHD1O14646 1710 aa46.59■■■■■ 5.05
NME2-202ENST00000393190 WDR97A6NE52 1622 aa46.59■■■■■ 5.05
NME2-202ENST00000393190 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.47■■■■■ 5.03
NME2-202ENST00000393190 FBLN2P98095 1184 aa46.47■■■■■ 5.03
NME2-202ENST00000393190 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.4■■■■■ 5.02
NME2-202ENST00000393190 GRIN2BQ13224 1484 aa46.4■■■■■ 5.02
NME2-202ENST00000393190 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.39■■■■■ 5.02
NME2-202ENST00000393190 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.39■■■■■ 5.02
NME2-202ENST00000393190 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.39■■■■■ 5.02
NME2-202ENST00000393190 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.39■■■■■ 5.02
NME2-202ENST00000393190 TOP2BQ02880 1626 aa46.37■■■■■ 5.01
NME2-202ENST00000393190 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.37■■■■■ 5.01
NME2-202ENST00000393190 SYNJ1O43426 1573 aa46.37■■■■■ 5.01
NME2-202ENST00000393190 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.34■■■■■ 5.01
NME2-202ENST00000393190 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
NME2-202ENST00000393190 ARHGEF11O15085 1522 aa46.3■■■■■ 5
NME2-202ENST00000393190 PBRM1Q86U86 1689 aa46.3■■■■■ 5
NME2-202ENST00000393190 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.29■■■■■ 5
NME2-202ENST00000393190 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.22■■■■■ 4.99
NME2-202ENST00000393190 SYNJ2O15056 1496 aa46.18■■■■■ 4.98
NME2-202ENST00000393190 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.08■■■■■ 4.97
NME2-202ENST00000393190 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.93■■■■■ 4.94
NME2-202ENST00000393190 ARAP1Q96P48 1450 aa45.92■■■■■ 4.94
NME2-202ENST00000393190 ADAMTS12P58397 1594 aa45.89■■■■■ 4.94
NME2-202ENST00000393190 GRIN2AQ12879 1464 aa45.82■■■■■ 4.93
NME2-202ENST00000393190 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.81■■■■■ 4.92
NME2-202ENST00000393190 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.76■■■■■ 4.92
NME2-202ENST00000393190 CEP170Q5SW79 1584 aa45.67■■■■■ 4.9
NME2-202ENST00000393190 NUP160Q12769 1436 aa45.66■■■■■ 4.9
NME2-202ENST00000393190 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.46■■■■■ 4.87
NME2-202ENST00000393190 KIF27Q86VH2 1401 aa45.44■■■■■ 4.87
NME2-202ENST00000393190 IGF1RP08069 1367 aa45.43■■■■■ 4.86
NME2-202ENST00000393190 SHROOM2Q13796 1616 aa45.39■■■■■ 4.86
NME2-202ENST00000393190 CUL7Q14999 1698 aa45.25■■■■■ 4.83
NME2-202ENST00000393190 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.22■■■■■ 4.83
NME2-202ENST00000393190 JPH4Q96JJ6 628 aa45.2■■■■■ 4.83
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