RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.79■■■■■ 7.8
RP9-201ENST00000297157 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.33■■■■■ 6.77
RP9-201ENST00000297157 ABCC9O60706 1549 aa57.22■■■■■ 6.75
RP9-201ENST00000297157 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.52■■■■■ 6.32
RP9-201ENST00000297157 NACADO15069 1562 aa54.17■■■■■ 6.26
RP9-201ENST00000297157 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.71■■■■■ 6.19
RP9-201ENST00000297157 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.57■■■■■ 6.17
RP9-201ENST00000297157 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.49■■■■■ 6.15
RP9-201ENST00000297157 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.31■■■■■ 6.13
RP9-201ENST00000297157 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.19■■■■■ 6.11
RP9-201ENST00000297157 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.99■■■■■ 6.07
RP9-201ENST00000297157 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.91■■■■■ 6.06
RP9-201ENST00000297157 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.77■■■■■ 6.04
RP9-201ENST00000297157 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.34■■■■■ 5.97
RP9-201ENST00000297157 SCRIBQ14160 1630 aa52.13■■■■■ 5.94
RP9-201ENST00000297157 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.75■■■■■ 5.88
RP9-201ENST00000297157 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.66■■■■■ 5.86
RP9-201ENST00000297157 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.59■■■■■ 5.85
RP9-201ENST00000297157 NCAPD3P42695 1498 aa50.01■■■■■ 5.6
RP9-201ENST00000297157 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.83■■■■■ 5.57
RP9-201ENST00000297157 SMARCA4P51532 1647 aa49.78■■■■■ 5.56
RP9-201ENST00000297157 SMARCA2P51531 1590 aa49.7■■■■■ 5.55
RP9-201ENST00000297157 HMGXB3Q12766 1538 aa49.67■■■■■ 5.54
RP9-201ENST00000297157 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.53■■■■■ 5.52
RP9-201ENST00000297157 CUX2O14529 1486 aa49.43■■■■■ 5.5
RP9-201ENST00000297157 ERCC6Q03468 1493 aa49.39■■■■■ 5.5
RP9-201ENST00000297157 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.37■■■■■ 5.49
RP9-201ENST00000297157 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.36■■■■■ 5.49
RP9-201ENST00000297157 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.31■■■■■ 5.48
RP9-201ENST00000297157 NESP48681 1621 aa49.17■■■■■ 5.46
RP9-201ENST00000297157 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.14■■■■■ 5.46
RP9-201ENST00000297157 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.89■■■■■ 5.42
RP9-201ENST00000297157 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.78■■■■■ 5.4
RP9-201ENST00000297157 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.57■■■■■ 5.37
RP9-201ENST00000297157 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.55■■■■■ 5.36
RP9-201ENST00000297157 WIZO95785 1651 aa48.53■■■■■ 5.36
RP9-201ENST00000297157 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.44■■■■■ 5.35
RP9-201ENST00000297157 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.16■■■■■ 5.3
RP9-201ENST00000297157 WDR62O43379 1518 aa48.1■■■■■ 5.29
RP9-201ENST00000297157 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.09■■■■■ 5.29
RP9-201ENST00000297157 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.96■■■■■ 5.27
RP9-201ENST00000297157 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.94■■■■■ 5.26
RP9-201ENST00000297157 CFTRP13569 1480 aa47.92■■■■■ 5.26
RP9-201ENST00000297157 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.89■■■■■ 5.26
RP9-201ENST00000297157 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.52■■■■■ 5.2
RP9-201ENST00000297157 PRDM2Q13029 1718 aa47.47■■■■■ 5.19
RP9-201ENST00000297157 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.37■■■■■ 5.17
RP9-201ENST00000297157 TRIM41Q8WV44 630 aa47.04■■■■■ 5.12
RP9-201ENST00000297157 OSCARQ8IYS5 282 aa47.03■■■■■ 5.12
RP9-201ENST00000297157 IFT140Q96RY7 1462 aa47.01■■■■■ 5.12
RP9-201ENST00000297157 TOPBP1Q92547 1522 aa47■■■■■ 5.12
RP9-201ENST00000297157 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
RP9-201ENST00000297157 ABCC8Q09428 1581 aa46.89■■■■■ 5.1
RP9-201ENST00000297157 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.84■■■■■ 5.09
RP9-201ENST00000297157 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
RP9-201ENST00000297157 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
RP9-201ENST00000297157 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.52■■■■■ 5.04
RP9-201ENST00000297157 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.52■■■■■ 5.04
RP9-201ENST00000297157 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.52■■■■■ 5.04
RP9-201ENST00000297157 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.52■■■■■ 5.04
RP9-201ENST00000297157 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.44■■■■■ 5.032e-6■■■■□ 21
RP9-201ENST00000297157 ARHGEF11O15085 1522 aa46.38■■■■■ 5.02
RP9-201ENST00000297157 CHD1O14646 1710 aa46.33■■■■■ 5.01
RP9-201ENST00000297157 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.3■■■■■ 5
RP9-201ENST00000297157 SOGA1O94964 1423 aa46.24■■■■■ 4.99
RP9-201ENST00000297157 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.2■■■■■ 4.99
RP9-201ENST00000297157 WDR97A6NE52 1622 aa46.19■■■■■ 4.98
RP9-201ENST00000297157 CUX1P39880 1505 aa46.18■■■■■ 4.98
RP9-201ENST00000297157 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
RP9-201ENST00000297157 FBLN2P98095 1184 aa46.02■■■■■ 4.96
RP9-201ENST00000297157 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.01■■■■■ 4.96
RP9-201ENST00000297157 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.94
RP9-201ENST00000297157 ARAP1Q96P48 1450 aa45.93■■■■■ 4.94
RP9-201ENST00000297157 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.93■■■■■ 4.94
RP9-201ENST00000297157 GRIN2BQ13224 1484 aa45.89■■■■■ 4.94
RP9-201ENST00000297157 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.89■■■■■ 4.94
RP9-201ENST00000297157 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.87■■■■■ 4.93
RP9-201ENST00000297157 SYNJ1O43426 1573 aa45.77■■■■■ 4.92
RP9-201ENST00000297157 SYNJ2O15056 1496 aa45.76■■■■■ 4.92
RP9-201ENST00000297157 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
RP9-201ENST00000297157 PBRM1Q86U86 1689 aa45.73■■■■■ 4.91
RP9-201ENST00000297157 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.72■■■■■ 4.91
RP9-201ENST00000297157 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.71■■■■■ 4.91
RP9-201ENST00000297157 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.68■■■■■ 4.9
RP9-201ENST00000297157 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.47■■■■■ 4.87
RP9-201ENST00000297157 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.46■■■■■ 4.87
RP9-201ENST00000297157 TOP2BQ02880 1626 aa45.44■■■■■ 4.87
RP9-201ENST00000297157 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.34■■■■■ 4.85
RP9-201ENST00000297157 ADAMTS12P58397 1594 aa45.33■■■■■ 4.85
RP9-201ENST00000297157 GRIN2AQ12879 1464 aa45.31■■■■■ 4.84
RP9-201ENST00000297157 NUP160Q12769 1436 aa45.2■■■■■ 4.83
RP9-201ENST00000297157 CEP170Q5SW79 1584 aa45.17■■■■■ 4.82
RP9-201ENST00000297157 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.15■■■■■ 4.82
RP9-201ENST00000297157 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.15■■■■■ 4.82
RP9-201ENST00000297157 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.09■■■■■ 4.81
RP9-201ENST00000297157 SHROOM2Q13796 1616 aa45.04■■■■■ 4.8
RP9-201ENST00000297157 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.7■■■■■ 4.75
RP9-201ENST00000297157 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
RP9-201ENST00000297157 JPH4Q96JJ6 628 aa44.61■■■■■ 4.73
RP9-201ENST00000297157 KIF27Q86VH2 1401 aa44.5■■■■■ 4.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms