RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.79■■■■■ 7.8
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RP9-201ENST00000297157 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.52■■■■■ 6.32
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RP9-201ENST00000297157 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.71■■■■■ 6.19
RP9-201ENST00000297157 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.57■■■■■ 6.17
RP9-201ENST00000297157 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.49■■■■■ 6.15
RP9-201ENST00000297157 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.31■■■■■ 6.13
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RP9-201ENST00000297157 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.75■■■■■ 5.88
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RP9-201ENST00000297157 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.44■■■■■ 5.35
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RP9-201ENST00000297157 OSCARQ8IYS5 282 aa47.03■■■■■ 5.12
RP9-201ENST00000297157 IFT140Q96RY7 1462 aa47.01■■■■■ 5.12
RP9-201ENST00000297157 TOPBP1Q92547 1522 aa47■■■■■ 5.12
RP9-201ENST00000297157 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
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RP9-201ENST00000297157 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.52■■■■■ 5.04
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RP9-201ENST00000297157 WDR97A6NE52 1622 aa46.19■■■■■ 4.98
RP9-201ENST00000297157 CUX1P39880 1505 aa46.18■■■■■ 4.98
RP9-201ENST00000297157 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
RP9-201ENST00000297157 FBLN2P98095 1184 aa46.02■■■■■ 4.96
RP9-201ENST00000297157 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.01■■■■■ 4.96
RP9-201ENST00000297157 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.94
RP9-201ENST00000297157 ARAP1Q96P48 1450 aa45.93■■■■■ 4.94
RP9-201ENST00000297157 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.93■■■■■ 4.94
RP9-201ENST00000297157 GRIN2BQ13224 1484 aa45.89■■■■■ 4.94
RP9-201ENST00000297157 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.89■■■■■ 4.94
RP9-201ENST00000297157 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.87■■■■■ 4.93
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RP9-201ENST00000297157 SYNJ2O15056 1496 aa45.76■■■■■ 4.92
RP9-201ENST00000297157 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
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RP9-201ENST00000297157 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.71■■■■■ 4.91
RP9-201ENST00000297157 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.68■■■■■ 4.9
RP9-201ENST00000297157 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.47■■■■■ 4.87
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RP9-201ENST00000297157 NUP160Q12769 1436 aa45.2■■■■■ 4.83
RP9-201ENST00000297157 CEP170Q5SW79 1584 aa45.17■■■■■ 4.82
RP9-201ENST00000297157 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.15■■■■■ 4.82
RP9-201ENST00000297157 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.15■■■■■ 4.82
RP9-201ENST00000297157 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.09■■■■■ 4.81
RP9-201ENST00000297157 SHROOM2Q13796 1616 aa45.04■■■■■ 4.8
RP9-201ENST00000297157 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.7■■■■■ 4.75
RP9-201ENST00000297157 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
RP9-201ENST00000297157 JPH4Q96JJ6 628 aa44.61■■■■■ 4.73
RP9-201ENST00000297157 KIF27Q86VH2 1401 aa44.5■■■■■ 4.71
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