RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513661.5

GRPEL2-204, Transcript of GrpE like 2, mitochondrial, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GRPEL2, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL2-204ENST00000513661 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.83■■■■■ 7.81
GRPEL2-204ENST00000513661 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.43■■■■■ 6.78
GRPEL2-204ENST00000513661 ABCC9O60706 1549 aa57.18■■■■■ 6.74
GRPEL2-204ENST00000513661 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.49■■■■■ 6.31
GRPEL2-204ENST00000513661 NACADO15069 1562 aa54.1■■■■■ 6.25
GRPEL2-204ENST00000513661 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.56■■■■■ 6.17
GRPEL2-204ENST00000513661 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.53■■■■■ 6.16
GRPEL2-204ENST00000513661 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.44■■■■■ 6.15
GRPEL2-204ENST00000513661 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.35■■■■■ 6.13
GRPEL2-204ENST00000513661 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.09■■■■■ 6.09
GRPEL2-204ENST00000513661 BICRAQ9NZM4 1560 aa53■■■■■ 6.07
GRPEL2-204ENST00000513661 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.99■■■■■ 6.07
GRPEL2-204ENST00000513661 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.72■■■■■ 6.03
GRPEL2-204ENST00000513661 SCRIBQ14160 1630 aa52.3■■■■■ 5.96
GRPEL2-204ENST00000513661 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.18■■■■■ 5.94
GRPEL2-204ENST00000513661 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.75■■■■■ 5.87
GRPEL2-204ENST00000513661 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.64■■■■■ 5.86
GRPEL2-204ENST00000513661 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.47■■■■■ 5.83
GRPEL2-204ENST00000513661 SMARCA4P51532 1647 aa49.89■■■■■ 5.58
GRPEL2-204ENST00000513661 NCAPD3P42695 1498 aa49.86■■■■■ 5.57
GRPEL2-204ENST00000513661 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.78■■■■■ 5.56
GRPEL2-204ENST00000513661 SMARCA2P51531 1590 aa49.67■■■■■ 5.54
GRPEL2-204ENST00000513661 HMGXB3Q12766 1538 aa49.65■■■■■ 5.54
GRPEL2-204ENST00000513661 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.55■■■■■ 5.52
GRPEL2-204ENST00000513661 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.36■■■■■ 5.49
GRPEL2-204ENST00000513661 ERCC6Q03468 1493 aa49.31■■■■■ 5.48
GRPEL2-204ENST00000513661 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.31■■■■■ 5.48
GRPEL2-204ENST00000513661 CUX2O14529 1486 aa49.23■■■■■ 5.47
GRPEL2-204ENST00000513661 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.22■■■■■ 5.47
GRPEL2-204ENST00000513661 NESP48681 1621 aa49.19■■■■■ 5.46
GRPEL2-204ENST00000513661 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.93■■■■■ 5.42
GRPEL2-204ENST00000513661 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.85■■■■■ 5.41
GRPEL2-204ENST00000513661 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.82■■■■■ 5.41
GRPEL2-204ENST00000513661 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.74■■■■■ 5.39
GRPEL2-204ENST00000513661 WIZO95785 1651 aa48.72■■■■■ 5.39
GRPEL2-204ENST00000513661 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.4■■■■■ 5.34
GRPEL2-204ENST00000513661 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.3■■■■■ 5.32
GRPEL2-204ENST00000513661 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.13■■■■■ 5.3
GRPEL2-204ENST00000513661 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.1■■■■■ 5.29
GRPEL2-204ENST00000513661 WDR62O43379 1518 aa48.07■■■■■ 5.29
GRPEL2-204ENST00000513661 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
GRPEL2-204ENST00000513661 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.93■■■■■ 5.26
GRPEL2-204ENST00000513661 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.86■■■■■ 5.25
GRPEL2-204ENST00000513661 CFTRP13569 1480 aa47.85■■■■■ 5.25
GRPEL2-204ENST00000513661 PRDM2Q13029 1718 aa47.74■■■■■ 5.23
GRPEL2-204ENST00000513661 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.53■■■■■ 5.2
GRPEL2-204ENST00000513661 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.4■■■■■ 5.18
GRPEL2-204ENST00000513661 TOPBP1Q92547 1522 aa47■■■■■ 5.12
GRPEL2-204ENST00000513661 IFT140Q96RY7 1462 aa46.92■■■■■ 5.1
GRPEL2-204ENST00000513661 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.91■■■■■ 5.1
GRPEL2-204ENST00000513661 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.89■■■■■ 5.1
GRPEL2-204ENST00000513661 TRIM41Q8WV44 630 aa46.86■■■■■ 5.09
GRPEL2-204ENST00000513661 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.8■■■■■ 5.08
GRPEL2-204ENST00000513661 ABCC8Q09428 1581 aa46.77■■■■■ 5.08
GRPEL2-204ENST00000513661 OSCARQ8IYS5 282 aa46.75■■■■■ 5.07
GRPEL2-204ENST00000513661 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.68■■■■■ 5.06
GRPEL2-204ENST00000513661 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.53■■■■■ 5.04
GRPEL2-204ENST00000513661 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.52■■■■■ 5.04
GRPEL2-204ENST00000513661 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.52■■■■■ 5.04
GRPEL2-204ENST00000513661 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.52■■■■■ 5.04
GRPEL2-204ENST00000513661 CHD1O14646 1710 aa46.51■■■■■ 5.04
GRPEL2-204ENST00000513661 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.41■■■■■ 5.022e-6■■■■□ 20.9
GRPEL2-204ENST00000513661 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.32■■■■■ 5.01
GRPEL2-204ENST00000513661 ARHGEF11O15085 1522 aa46.31■■■■■ 5
GRPEL2-204ENST00000513661 CUX1P39880 1505 aa46.27■■■■■ 5
GRPEL2-204ENST00000513661 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.25■■■■■ 5
GRPEL2-204ENST00000513661 SOGA1O94964 1423 aa46.17■■■■■ 4.98
GRPEL2-204ENST00000513661 WDR97A6NE52 1622 aa46.16■■■■■ 4.98
GRPEL2-204ENST00000513661 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.09■■■■■ 4.97
GRPEL2-204ENST00000513661 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.03■■■■■ 4.96
GRPEL2-204ENST00000513661 PBRM1Q86U86 1689 aa45.95■■■■■ 4.95
GRPEL2-204ENST00000513661 FBLN2P98095 1184 aa45.93■■■■■ 4.94
GRPEL2-204ENST00000513661 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
GRPEL2-204ENST00000513661 ARAP1Q96P48 1450 aa45.87■■■■■ 4.93
GRPEL2-204ENST00000513661 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.87■■■■■ 4.93
GRPEL2-204ENST00000513661 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.85■■■■■ 4.93
GRPEL2-204ENST00000513661 GRIN2BQ13224 1484 aa45.83■■■■■ 4.93
GRPEL2-204ENST00000513661 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.79■■■■■ 4.92
GRPEL2-204ENST00000513661 SYNJ1O43426 1573 aa45.76■■■■■ 4.92
GRPEL2-204ENST00000513661 SYNJ2O15056 1496 aa45.71■■■■■ 4.91
GRPEL2-204ENST00000513661 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.71■■■■■ 4.91
GRPEL2-204ENST00000513661 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.7■■■■■ 4.91
GRPEL2-204ENST00000513661 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.68■■■■■ 4.9
GRPEL2-204ENST00000513661 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.63■■■■■ 4.9
GRPEL2-204ENST00000513661 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
GRPEL2-204ENST00000513661 TOP2BQ02880 1626 aa45.55■■■■■ 4.88
GRPEL2-204ENST00000513661 ADAMTS12P58397 1594 aa45.43■■■■■ 4.86
GRPEL2-204ENST00000513661 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.43■■■■■ 4.86
GRPEL2-204ENST00000513661 GRIN2AQ12879 1464 aa45.31■■■■■ 4.84
GRPEL2-204ENST00000513661 CEP170Q5SW79 1584 aa45.25■■■■■ 4.83
GRPEL2-204ENST00000513661 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.16■■■■■ 4.82
GRPEL2-204ENST00000513661 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.14■■■■■ 4.82
GRPEL2-204ENST00000513661 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.14■■■■■ 4.82
GRPEL2-204ENST00000513661 NUP160Q12769 1436 aa45.13■■■■■ 4.82
GRPEL2-204ENST00000513661 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.08■■■■■ 4.81
GRPEL2-204ENST00000513661 SHROOM2Q13796 1616 aa45.07■■■■■ 4.81
GRPEL2-204ENST00000513661 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.81■■■■■ 4.76
GRPEL2-204ENST00000513661 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
GRPEL2-204ENST00000513661 CUL7Q14999 1698 aa44.6■■■■■ 4.73
GRPEL2-204ENST00000513661 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.51■■■■■ 4.72
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