RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597743.5

CALM3-209, Transcript of calmodulin 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene CALM3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3-209ENST00000597743 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.28■■■■■ 7.72
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CALM3-209ENST00000597743 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.11■■■■■ 6.25
CALM3-209ENST00000597743 NACADO15069 1562 aa53.73■■■■■ 6.19
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CALM3-209ENST00000597743 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.98■■■■■ 6.07
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CALM3-209ENST00000597743 SCRIBQ14160 1630 aa51.72■■■■■ 5.87
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CALM3-209ENST00000597743 SMARCA2P51531 1590 aa49.33■■■■■ 5.49
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CALM3-209ENST00000597743 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.98■■■■■ 5.43
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CALM3-209ENST00000597743 NESP48681 1621 aa48.74■■■■■ 5.39
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CALM3-209ENST00000597743 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.23■■■■■ 5.31
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CALM3-209ENST00000597743 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.78■■■■■ 5.24
CALM3-209ENST00000597743 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.74■■■■■ 5.23
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CALM3-209ENST00000597743 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.61■■■■■ 5.21
CALM3-209ENST00000597743 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
CALM3-209ENST00000597743 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.54■■■■■ 5.2
CALM3-209ENST00000597743 CFTRP13569 1480 aa47.53■■■■■ 5.2
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CALM3-209ENST00000597743 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.03■■■■■ 5.12
CALM3-209ENST00000597743 TRIM41Q8WV44 630 aa46.85■■■■■ 5.09
CALM3-209ENST00000597743 OSCARQ8IYS5 282 aa46.83■■■■■ 5.09
CALM3-209ENST00000597743 IFT140Q96RY7 1462 aa46.66■■■■■ 5.06
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CALM3-209ENST00000597743 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.09■■■■■ 4.97
CALM3-209ENST00000597743 SOGA1O94964 1423 aa45.99■■■■■ 4.95
CALM3-209ENST00000597743 ARHGEF11O15085 1522 aa45.97■■■■■ 4.95
CALM3-209ENST00000597743 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.96■■■■■ 4.95
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CALM3-209ENST00000597743 CUX1P39880 1505 aa45.78■■■■■ 4.92
CALM3-209ENST00000597743 WDR97A6NE52 1622 aa45.78■■■■■ 4.92
CALM3-209ENST00000597743 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.71■■■■■ 4.91
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CALM3-209ENST00000597743 SYNJ2O15056 1496 aa45.42■■■■■ 4.86
CALM3-209ENST00000597743 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.42■■■■■ 4.86
CALM3-209ENST00000597743 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.39■■■■■ 4.86
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CALM3-209ENST00000597743 JPH4Q96JJ6 628 aa44.43■■■■■ 4.7
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CALM3-209ENST00000597743 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.26■■■■■ 4.68
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