RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299736.4

CENPV-201, Transcript of centromere protein V, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPV, Length 1,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPV-201ENST00000299736 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.57■■■■■ 7.77
CENPV-201ENST00000299736 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.12■■■■■ 6.73
CENPV-201ENST00000299736 ABCC9O60706 1549 aa57.01■■■■■ 6.72
CENPV-201ENST00000299736 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.34■■■■■ 6.29
CENPV-201ENST00000299736 NACADO15069 1562 aa53.96■■■■■ 6.23
CENPV-201ENST00000299736 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.57■■■■■ 6.17
CENPV-201ENST00000299736 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.43■■■■■ 6.14
CENPV-201ENST00000299736 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.23■■■■■ 6.11
CENPV-201ENST00000299736 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.15■■■■■ 6.1
CENPV-201ENST00000299736 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.04■■■■■ 6.08
CENPV-201ENST00000299736 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.72■■■■■ 6.03
CENPV-201ENST00000299736 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.69■■■■■ 6.02
CENPV-201ENST00000299736 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.55■■■■■ 6
CENPV-201ENST00000299736 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.07■■■■■ 5.93
CENPV-201ENST00000299736 SCRIBQ14160 1630 aa51.97■■■■■ 5.91
CENPV-201ENST00000299736 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.55■■■■■ 5.84
CENPV-201ENST00000299736 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.44■■■■■ 5.82
CENPV-201ENST00000299736 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.37■■■■■ 5.81
CENPV-201ENST00000299736 NCAPD3P42695 1498 aa49.79■■■■■ 5.56
CENPV-201ENST00000299736 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.63■■■■■ 5.54
CENPV-201ENST00000299736 SMARCA4P51532 1647 aa49.61■■■■■ 5.53
CENPV-201ENST00000299736 SMARCA2P51531 1590 aa49.53■■■■■ 5.52
CENPV-201ENST00000299736 HMGXB3Q12766 1538 aa49.45■■■■■ 5.51
CENPV-201ENST00000299736 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.36■■■■■ 5.49
CENPV-201ENST00000299736 ERCC6Q03468 1493 aa49.25■■■■■ 5.47
CENPV-201ENST00000299736 CUX2O14529 1486 aa49.19■■■■■ 5.47
CENPV-201ENST00000299736 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.16■■■■■ 5.46
CENPV-201ENST00000299736 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.15■■■■■ 5.46
CENPV-201ENST00000299736 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.11■■■■■ 5.45
CENPV-201ENST00000299736 NESP48681 1621 aa48.98■■■■■ 5.43
CENPV-201ENST00000299736 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.96■■■■■ 5.43
CENPV-201ENST00000299736 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.7■■■■■ 5.39
CENPV-201ENST00000299736 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.54■■■■■ 5.36
CENPV-201ENST00000299736 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.42■■■■■ 5.34
CENPV-201ENST00000299736 WIZO95785 1651 aa48.4■■■■■ 5.34
CENPV-201ENST00000299736 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.4■■■■■ 5.34
CENPV-201ENST00000299736 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.26■■■■■ 5.32
CENPV-201ENST00000299736 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.97■■■■■ 5.27
CENPV-201ENST00000299736 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.94■■■■■ 5.26
CENPV-201ENST00000299736 WDR62O43379 1518 aa47.87■■■■■ 5.25
CENPV-201ENST00000299736 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
CENPV-201ENST00000299736 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.78■■■■■ 5.24
CENPV-201ENST00000299736 CFTRP13569 1480 aa47.72■■■■■ 5.23
CENPV-201ENST00000299736 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.72■■■■■ 5.23
CENPV-201ENST00000299736 PRDM2Q13029 1718 aa47.36■■■■■ 5.17
CENPV-201ENST00000299736 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.32■■■■■ 5.17
CENPV-201ENST00000299736 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.22■■■■■ 5.15
CENPV-201ENST00000299736 TRIM41Q8WV44 630 aa46.93■■■■■ 5.1
CENPV-201ENST00000299736 OSCARQ8IYS5 282 aa46.9■■■■■ 5.1
CENPV-201ENST00000299736 IFT140Q96RY7 1462 aa46.83■■■■■ 5.09
CENPV-201ENST00000299736 TOPBP1Q92547 1522 aa46.83■■■■■ 5.09
CENPV-201ENST00000299736 ABCC8Q09428 1581 aa46.76■■■■■ 5.08
CENPV-201ENST00000299736 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.72■■■■■ 5.07
CENPV-201ENST00000299736 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.68■■■■■ 5.06
CENPV-201ENST00000299736 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.52■■■■■ 5.04
CENPV-201ENST00000299736 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
CENPV-201ENST00000299736 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.34■■■■■ 5.01
CENPV-201ENST00000299736 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.33■■■■■ 5.01
CENPV-201ENST00000299736 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.33■■■■■ 5.01
CENPV-201ENST00000299736 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.33■■■■■ 5.01
CENPV-201ENST00000299736 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.3■■■■■ 52e-7■■■■□ 22.7
CENPV-201ENST00000299736 CHD1O14646 1710 aa46.2■■■■■ 4.99
CENPV-201ENST00000299736 ARHGEF11O15085 1522 aa46.17■■■■■ 4.98
CENPV-201ENST00000299736 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.14■■■■■ 4.98
CENPV-201ENST00000299736 SOGA1O94964 1423 aa46.11■■■■■ 4.97
CENPV-201ENST00000299736 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.05■■■■■ 4.96
CENPV-201ENST00000299736 WDR97A6NE52 1622 aa46.01■■■■■ 4.96
CENPV-201ENST00000299736 CUX1P39880 1505 aa46.01■■■■■ 4.96
CENPV-201ENST00000299736 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
CENPV-201ENST00000299736 FBLN2P98095 1184 aa45.97■■■■■ 4.95
CENPV-201ENST00000299736 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.85■■■■■ 4.93
CENPV-201ENST00000299736 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.78■■■■■ 4.92
CENPV-201ENST00000299736 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
CENPV-201ENST00000299736 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.75■■■■■ 4.91
CENPV-201ENST00000299736 GRIN2BQ13224 1484 aa45.74■■■■■ 4.91
CENPV-201ENST00000299736 ARAP1Q96P48 1450 aa45.7■■■■■ 4.91
CENPV-201ENST00000299736 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
CENPV-201ENST00000299736 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.64■■■■■ 4.9
CENPV-201ENST00000299736 SYNJ1O43426 1573 aa45.62■■■■■ 4.89
CENPV-201ENST00000299736 PBRM1Q86U86 1689 aa45.62■■■■■ 4.89
CENPV-201ENST00000299736 SYNJ2O15056 1496 aa45.59■■■■■ 4.89
CENPV-201ENST00000299736 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.58■■■■■ 4.89
CENPV-201ENST00000299736 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.55■■■■■ 4.88
CENPV-201ENST00000299736 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.5■■■■■ 4.87
CENPV-201ENST00000299736 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.35■■■■■ 4.85
CENPV-201ENST00000299736 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.33■■■■■ 4.85
CENPV-201ENST00000299736 TOP2BQ02880 1626 aa45.3■■■■■ 4.84
CENPV-201ENST00000299736 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.27■■■■■ 4.84
CENPV-201ENST00000299736 GRIN2AQ12879 1464 aa45.15■■■■■ 4.82
CENPV-201ENST00000299736 ADAMTS12P58397 1594 aa45.15■■■■■ 4.82
CENPV-201ENST00000299736 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45■■■■■ 4.79
CENPV-201ENST00000299736 NUP160Q12769 1436 aa45■■■■■ 4.79
CENPV-201ENST00000299736 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.99■■■■■ 4.79
CENPV-201ENST00000299736 CEP170Q5SW79 1584 aa44.99■■■■■ 4.79
CENPV-201ENST00000299736 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.89■■■■■ 4.78
CENPV-201ENST00000299736 SHROOM2Q13796 1616 aa44.83■■■■■ 4.77
CENPV-201ENST00000299736 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
CENPV-201ENST00000299736 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.51■■■■■ 4.72
CENPV-201ENST00000299736 JPH4Q96JJ6 628 aa44.51■■■■■ 4.72
CENPV-201ENST00000299736 KIF27Q86VH2 1401 aa44.4■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms