RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343484.9

TCEA2-202, Transcript of transcription elongation factor A2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TCEA2, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2-202ENST00000343484 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.54■■■■■ 7.92
TCEA2-202ENST00000343484 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.39■■■■■ 6.78
TCEA2-202ENST00000343484 ABCC9O60706 1549 aa56.55■■■■■ 6.64
TCEA2-202ENST00000343484 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.26■■■■■ 6.28
TCEA2-202ENST00000343484 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.22■■■■■ 6.27
TCEA2-202ENST00000343484 NACADO15069 1562 aa54.09■■■■■ 6.25
TCEA2-202ENST00000343484 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.67■■■■■ 6.18
TCEA2-202ENST00000343484 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.64■■■■■ 6.18
TCEA2-202ENST00000343484 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.33■■■■■ 6.13
TCEA2-202ENST00000343484 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.9■■■■■ 6.06
TCEA2-202ENST00000343484 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.89■■■■■ 6.06
TCEA2-202ENST00000343484 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.55■■■■■ 6
TCEA2-202ENST00000343484 SCRIBQ14160 1630 aa52.44■■■■■ 5.99
TCEA2-202ENST00000343484 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.17■■■■■ 5.94
TCEA2-202ENST00000343484 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.95■■■■■ 5.91
TCEA2-202ENST00000343484 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.21■■■■■ 5.79
TCEA2-202ENST00000343484 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.08■■■■■ 5.77
TCEA2-202ENST00000343484 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.83■■■■■ 5.73
TCEA2-202ENST00000343484 SMARCA4P51532 1647 aa50.11■■■■■ 5.61
TCEA2-202ENST00000343484 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.03■■■■■ 5.6
TCEA2-202ENST00000343484 NCAPD3P42695 1498 aa49.95■■■■■ 5.59
TCEA2-202ENST00000343484 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.94■■■■■ 5.58
TCEA2-202ENST00000343484 SMARCA2P51531 1590 aa49.84■■■■■ 5.57
TCEA2-202ENST00000343484 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.75■■■■■ 5.55
TCEA2-202ENST00000343484 HMGXB3Q12766 1538 aa49.61■■■■■ 5.53
TCEA2-202ENST00000343484 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.58■■■■■ 5.53
TCEA2-202ENST00000343484 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.53■■■■■ 5.52
TCEA2-202ENST00000343484 WIZO95785 1651 aa49.19■■■■■ 5.46
TCEA2-202ENST00000343484 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.11■■■■■ 5.45
TCEA2-202ENST00000343484 NESP48681 1621 aa48.84■■■■■ 5.41
TCEA2-202ENST00000343484 ERCC6Q03468 1493 aa48.78■■■■■ 5.4
TCEA2-202ENST00000343484 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.63■■■■■ 5.38
TCEA2-202ENST00000343484 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.63■■■■■ 5.38
TCEA2-202ENST00000343484 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.51■■■■■ 5.36
TCEA2-202ENST00000343484 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.4■■■■■ 5.34
TCEA2-202ENST00000343484 CUX2O14529 1486 aa48.28■■■■■ 5.32
TCEA2-202ENST00000343484 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.18■■■■■ 5.3
TCEA2-202ENST00000343484 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.13■■■■■ 5.3
TCEA2-202ENST00000343484 CFTRP13569 1480 aa48.13■■■■■ 5.3
TCEA2-202ENST00000343484 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
TCEA2-202ENST00000343484 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.94■■■■■ 5.26
TCEA2-202ENST00000343484 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.9■■■■■ 5.26
TCEA2-202ENST00000343484 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.87■■■■■ 5.25
TCEA2-202ENST00000343484 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
TCEA2-202ENST00000343484 WDR62O43379 1518 aa47.67■■■■■ 5.22
TCEA2-202ENST00000343484 PRDM2Q13029 1718 aa47.63■■■■■ 5.22
TCEA2-202ENST00000343484 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
TCEA2-202ENST00000343484 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.18■■■■■ 5.14
TCEA2-202ENST00000343484 TOPBP1Q92547 1522 aa47.13■■■■■ 5.14
TCEA2-202ENST00000343484 ABCC8Q09428 1581 aa47.12■■■■■ 5.13
TCEA2-202ENST00000343484 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.03■■■■■ 5.12
TCEA2-202ENST00000343484 IFT140Q96RY7 1462 aa46.9■■■■■ 5.1
TCEA2-202ENST00000343484 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.73■■■■■ 5.07
TCEA2-202ENST00000343484 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.71■■■■■ 5.07
TCEA2-202ENST00000343484 CUX1P39880 1505 aa46.68■■■■■ 5.06
TCEA2-202ENST00000343484 SOGA1O94964 1423 aa46.59■■■■■ 5.05
TCEA2-202ENST00000343484 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.58■■■■■ 5.05
TCEA2-202ENST00000343484 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.57■■■■■ 5.05
TCEA2-202ENST00000343484 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.56■■■■■ 5.04
TCEA2-202ENST00000343484 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.47■■■■■ 5.03
TCEA2-202ENST00000343484 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.46■■■■■ 5.03
TCEA2-202ENST00000343484 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.37■■■■■ 5.01
TCEA2-202ENST00000343484 OSCARQ8IYS5 282 aa46.36■■■■■ 5.01
TCEA2-202ENST00000343484 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.33■■■■■ 5.01
TCEA2-202ENST00000343484 TOP2BQ02880 1626 aa46.19■■■■■ 4.98
TCEA2-202ENST00000343484 SYNJ1O43426 1573 aa46.18■■■■■ 4.98
TCEA2-202ENST00000343484 WDR97A6NE52 1622 aa46.17■■■■■ 4.98
TCEA2-202ENST00000343484 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.15■■■■■ 4.98
TCEA2-202ENST00000343484 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.09■■■■■ 4.97
TCEA2-202ENST00000343484 FBLN2P98095 1184 aa46.07■■■■■ 4.97
TCEA2-202ENST00000343484 GRIN2BQ13224 1484 aa46.03■■■■■ 4.96
TCEA2-202ENST00000343484 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.01■■■■■ 4.96
TCEA2-202ENST00000343484 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46■■■■■ 4.95
TCEA2-202ENST00000343484 CHD1O14646 1710 aa45.91■■■■■ 4.94
TCEA2-202ENST00000343484 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.9■■■■■ 4.94
TCEA2-202ENST00000343484 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.88■■■■■ 4.94
TCEA2-202ENST00000343484 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.87■■■■■ 4.93
TCEA2-202ENST00000343484 PBRM1Q86U86 1689 aa45.83■■■■■ 4.93
TCEA2-202ENST00000343484 SYNJ2O15056 1496 aa45.74■■■■■ 4.91
TCEA2-202ENST00000343484 TRIM41Q8WV44 630 aa45.6■■■■■ 4.89
TCEA2-202ENST00000343484 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.52■■■■■ 4.88
TCEA2-202ENST00000343484 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.51■■■■■ 4.88
TCEA2-202ENST00000343484 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.51■■■■■ 4.88
TCEA2-202ENST00000343484 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.51■■■■■ 4.88
TCEA2-202ENST00000343484 ARHGEF11O15085 1522 aa45.5■■■■■ 4.87
TCEA2-202ENST00000343484 ADAMTS12P58397 1594 aa45.48■■■■■ 4.87
TCEA2-202ENST00000343484 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.47■■■■■ 4.87
TCEA2-202ENST00000343484 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.42■■■■■ 4.86
TCEA2-202ENST00000343484 GRIN2AQ12879 1464 aa45.42■■■■■ 4.86
TCEA2-202ENST00000343484 KIF27Q86VH2 1401 aa45.4■■■■■ 4.86
TCEA2-202ENST00000343484 IGF1RP08069 1367 aa45.26■■■■■ 4.84
TCEA2-202ENST00000343484 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.23■■■■■ 4.83
TCEA2-202ENST00000343484 NUP160Q12769 1436 aa45.21■■■■■ 4.83
TCEA2-202ENST00000343484 CEP170Q5SW79 1584 aa45.17■■■■■ 4.82
TCEA2-202ENST00000343484 ARAP1Q96P48 1450 aa45.11■■■■■ 4.81
TCEA2-202ENST00000343484 CUL7Q14999 1698 aa45.04■■■■■ 4.8
TCEA2-202ENST00000343484 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45■■■■■ 4.79
TCEA2-202ENST00000343484 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.91■■■■■ 4.78
TCEA2-202ENST00000343484 JPH4Q96JJ6 628 aa44.86■■■■■ 4.77
TCEA2-202ENST00000343484 SHROOM2Q13796 1616 aa44.84■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms