RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521545.6

LAPTM4B-203, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAPTM4B, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-203ENST00000521545 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.07■■■■■ 7.85
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LAPTM4B-203ENST00000521545 ABCC9O60706 1549 aa56.89■■■■■ 6.7
LAPTM4B-203ENST00000521545 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.36■■■■■ 6.29
LAPTM4B-203ENST00000521545 NACADO15069 1562 aa54.08■■■■■ 6.25
LAPTM4B-203ENST00000521545 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.06■■■■■ 6.24
LAPTM4B-203ENST00000521545 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.47■■■■■ 6.15
LAPTM4B-203ENST00000521545 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.16■■■■■ 6.1
LAPTM4B-203ENST00000521545 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.08■■■■■ 6.09
LAPTM4B-203ENST00000521545 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.01■■■■■ 6.08
LAPTM4B-203ENST00000521545 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.96■■■■■ 6.07
LAPTM4B-203ENST00000521545 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.94■■■■■ 6.07
LAPTM4B-203ENST00000521545 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.67■■■■■ 6.02
LAPTM4B-203ENST00000521545 SCRIBQ14160 1630 aa52.23■■■■■ 5.95
LAPTM4B-203ENST00000521545 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.07■■■■■ 5.93
LAPTM4B-203ENST00000521545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.38■■■■■ 5.82
LAPTM4B-203ENST00000521545 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.38■■■■■ 5.82
LAPTM4B-203ENST00000521545 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.22■■■■■ 5.79
LAPTM4B-203ENST00000521545 NCAPD3P42695 1498 aa49.93■■■■■ 5.58
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LAPTM4B-203ENST00000521545 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.82■■■■■ 5.57
LAPTM4B-203ENST00000521545 SMARCA2P51531 1590 aa49.74■■■■■ 5.55
LAPTM4B-203ENST00000521545 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.72■■■■■ 5.55
LAPTM4B-203ENST00000521545 HMGXB3Q12766 1538 aa49.57■■■■■ 5.53
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LAPTM4B-203ENST00000521545 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.36■■■■■ 5.49
LAPTM4B-203ENST00000521545 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.35■■■■■ 5.49
LAPTM4B-203ENST00000521545 ERCC6Q03468 1493 aa49.15■■■■■ 5.46
LAPTM4B-203ENST00000521545 NESP48681 1621 aa48.96■■■■■ 5.43
LAPTM4B-203ENST00000521545 CUX2O14529 1486 aa48.86■■■■■ 5.41
LAPTM4B-203ENST00000521545 WIZO95785 1651 aa48.77■■■■■ 5.4
LAPTM4B-203ENST00000521545 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.73■■■■■ 5.39
LAPTM4B-203ENST00000521545 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.51■■■■■ 5.36
LAPTM4B-203ENST00000521545 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.49■■■■■ 5.35
LAPTM4B-203ENST00000521545 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.46■■■■■ 5.35
LAPTM4B-203ENST00000521545 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.38■■■■■ 5.34
LAPTM4B-203ENST00000521545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
LAPTM4B-203ENST00000521545 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.32■■■■■ 5.33
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LAPTM4B-203ENST00000521545 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.99■■■■■ 5.27
LAPTM4B-203ENST00000521545 CFTRP13569 1480 aa47.97■■■■■ 5.27
LAPTM4B-203ENST00000521545 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.91■■■■■ 5.26
LAPTM4B-203ENST00000521545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.89■■■■■ 5.26
LAPTM4B-203ENST00000521545 WDR62O43379 1518 aa47.81■■■■■ 5.24
LAPTM4B-203ENST00000521545 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.68■■■■■ 5.22
LAPTM4B-203ENST00000521545 PRDM2Q13029 1718 aa47.47■■■■■ 5.19
LAPTM4B-203ENST00000521545 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
LAPTM4B-203ENST00000521545 TOPBP1Q92547 1522 aa47.02■■■■■ 5.12
LAPTM4B-203ENST00000521545 ABCC8Q09428 1581 aa47.02■■■■■ 5.12
LAPTM4B-203ENST00000521545 IFT140Q96RY7 1462 aa46.94■■■■■ 5.1
LAPTM4B-203ENST00000521545 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.88■■■■■ 5.1
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LAPTM4B-203ENST00000521545 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.77■■■■■ 5.08
LAPTM4B-203ENST00000521545 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.56■■■■■ 5.04
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LAPTM4B-203ENST00000521545 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.52■■■■■ 5.04
LAPTM4B-203ENST00000521545 TRIM41Q8WV44 630 aa46.49■■■■■ 5.03
LAPTM4B-203ENST00000521545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.44■■■■■ 5.03
LAPTM4B-203ENST00000521545 SOGA1O94964 1423 aa46.42■■■■■ 5.02
LAPTM4B-203ENST00000521545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.38■■■■■ 5.02
LAPTM4B-203ENST00000521545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.34■■■■■ 5.01
LAPTM4B-203ENST00000521545 CUX1P39880 1505 aa46.33■■■■■ 5.01
LAPTM4B-203ENST00000521545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.25■■■■■ 4.99
LAPTM4B-203ENST00000521545 FBLN2P98095 1184 aa46.17■■■■■ 4.98
LAPTM4B-203ENST00000521545 WDR97A6NE52 1622 aa46.12■■■■■ 4.97
LAPTM4B-203ENST00000521545 CHD1O14646 1710 aa46.08■■■■■ 4.97
LAPTM4B-203ENST00000521545 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.01■■■■■ 4.96
LAPTM4B-203ENST00000521545 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.01■■■■■ 4.96
LAPTM4B-203ENST00000521545 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.01■■■■■ 4.96
LAPTM4B-203ENST00000521545 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.97■■■■■ 4.95
LAPTM4B-203ENST00000521545 GRIN2BQ13224 1484 aa45.94■■■■■ 4.95
LAPTM4B-203ENST00000521545 ARHGEF11O15085 1522 aa45.93■■■■■ 4.94
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LAPTM4B-203ENST00000521545 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
LAPTM4B-203ENST00000521545 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.84■■■■■ 4.93
LAPTM4B-203ENST00000521545 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.84■■■■■ 4.93
LAPTM4B-203ENST00000521545 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.8■■■■■ 4.92
LAPTM4B-203ENST00000521545 TOP2BQ02880 1626 aa45.73■■■■■ 4.91
LAPTM4B-203ENST00000521545 SYNJ2O15056 1496 aa45.73■■■■■ 4.91
LAPTM4B-203ENST00000521545 PBRM1Q86U86 1689 aa45.72■■■■■ 4.91
LAPTM4B-203ENST00000521545 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.7■■■■■ 4.91
LAPTM4B-203ENST00000521545 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.68■■■■■ 4.9
LAPTM4B-203ENST00000521545 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.67■■■■■ 4.9
LAPTM4B-203ENST00000521545 SYNJ1O43426 1573 aa45.66■■■■■ 4.9
LAPTM4B-203ENST00000521545 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.57■■■■■ 4.88
LAPTM4B-203ENST00000521545 ARAP1Q96P48 1450 aa45.49■■■■■ 4.87
LAPTM4B-203ENST00000521545 GRIN2AQ12879 1464 aa45.33■■■■■ 4.85
LAPTM4B-203ENST00000521545 ADAMTS12P58397 1594 aa45.31■■■■■ 4.84
LAPTM4B-203ENST00000521545 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.28■■■■■ 4.84
LAPTM4B-203ENST00000521545 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.28■■■■■ 4.84
LAPTM4B-203ENST00000521545 NUP160Q12769 1436 aa45.14■■■■■ 4.82
LAPTM4B-203ENST00000521545 CEP170Q5SW79 1584 aa45.1■■■■■ 4.81
LAPTM4B-203ENST00000521545 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.07■■■■■ 4.81
LAPTM4B-203ENST00000521545 KIF27Q86VH2 1401 aa44.93■■■■■ 4.78
LAPTM4B-203ENST00000521545 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.88■■■■■ 4.78
LAPTM4B-203ENST00000521545 SHROOM2Q13796 1616 aa44.86■■■■■ 4.77
LAPTM4B-203ENST00000521545 IGF1RP08069 1367 aa44.83■■■■■ 4.77
LAPTM4B-203ENST00000521545 JPH4Q96JJ6 628 aa44.79■■■■■ 4.76
LAPTM4B-203ENST00000521545 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
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