RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640271.1

AL451007.3-201, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene AL451007.3, Length 588 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL451007.3-201ENST00000640271 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.28■■■■■ 7.88
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AL451007.3-201ENST00000640271 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.33■■■■■ 6.13
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AL451007.3-201ENST00000640271 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.3■■■■■ 5.96
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AL451007.3-201ENST00000640271 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.66■■■■■ 5.86
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AL451007.3-201ENST00000640271 SMARCA2P51531 1590 aa49.91■■■■■ 5.58
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AL451007.3-201ENST00000640271 NESP48681 1621 aa49.24■■■■■ 5.47
AL451007.3-201ENST00000640271 CUX2O14529 1486 aa49.14■■■■■ 5.46
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AL451007.3-201ENST00000640271 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.94■■■■■ 5.42
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AL451007.3-201ENST00000640271 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.65■■■■■ 5.38
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AL451007.3-201ENST00000640271 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.6■■■■■ 5.37
AL451007.3-201ENST00000640271 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.37■■■■■ 5.33
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AL451007.3-201ENST00000640271 CFTRP13569 1480 aa48.15■■■■■ 5.3
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AL451007.3-201ENST00000640271 WDR62O43379 1518 aa48.08■■■■■ 5.29
AL451007.3-201ENST00000640271 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.08■■■■■ 5.29
AL451007.3-201ENST00000640271 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.82■■■■■ 5.25
AL451007.3-201ENST00000640271 PRDM2Q13029 1718 aa47.67■■■■■ 5.22
AL451007.3-201ENST00000640271 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
AL451007.3-201ENST00000640271 TOPBP1Q92547 1522 aa47.2■■■■■ 5.15
AL451007.3-201ENST00000640271 IFT140Q96RY7 1462 aa47.12■■■■■ 5.13
AL451007.3-201ENST00000640271 ABCC8Q09428 1581 aa47.11■■■■■ 5.13
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AL451007.3-201ENST00000640271 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.51■■■■■ 5.04
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AL451007.3-201ENST00000640271 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.32■■■■■ 5
AL451007.3-201ENST00000640271 WDR97A6NE52 1622 aa46.29■■■■■ 5
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AL451007.3-201ENST00000640271 GRIN2BQ13224 1484 aa46.1■■■■■ 4.97
AL451007.3-201ENST00000640271 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
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AL451007.3-201ENST00000640271 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.99■■■■■ 4.95
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AL451007.3-201ENST00000640271 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.89■■■■■ 4.94
AL451007.3-201ENST00000640271 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.89■■■■■ 4.94
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AL451007.3-201ENST00000640271 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.83■■■■■ 4.93
AL451007.3-201ENST00000640271 ARAP1Q96P48 1450 aa45.79■■■■■ 4.92
AL451007.3-201ENST00000640271 ADAMTS12P58397 1594 aa45.53■■■■■ 4.88
AL451007.3-201ENST00000640271 GRIN2AQ12879 1464 aa45.51■■■■■ 4.88
AL451007.3-201ENST00000640271 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.42■■■■■ 4.86
AL451007.3-201ENST00000640271 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.42■■■■■ 4.86
AL451007.3-201ENST00000640271 NUP160Q12769 1436 aa45.35■■■■■ 4.85
AL451007.3-201ENST00000640271 CEP170Q5SW79 1584 aa45.33■■■■■ 4.85
AL451007.3-201ENST00000640271 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.24■■■■■ 4.83
AL451007.3-201ENST00000640271 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.16■■■■■ 4.82
AL451007.3-201ENST00000640271 SHROOM2Q13796 1616 aa45.08■■■■■ 4.81
AL451007.3-201ENST00000640271 KIF27Q86VH2 1401 aa45■■■■■ 4.79
AL451007.3-201ENST00000640271 IGF1RP08069 1367 aa44.94■■■■■ 4.78
AL451007.3-201ENST00000640271 JPH4Q96JJ6 628 aa44.89■■■■■ 4.78
AL451007.3-201ENST00000640271 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.88■■■■■ 4.78
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