RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529806.5

RPS2-209, Transcript of ribosomal protein S2, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RPS2, Length 993 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS2-209ENST00000529806 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.59■■■■■ 7.93
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RPS2-209ENST00000529806 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.24■■■■■ 6.27
RPS2-209ENST00000529806 NACADO15069 1562 aa54.1■■■■■ 6.25
RPS2-209ENST00000529806 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.99■■■■■ 6.23
RPS2-209ENST00000529806 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.8■■■■■ 6.2
RPS2-209ENST00000529806 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.67■■■■■ 6.18
RPS2-209ENST00000529806 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.44■■■■■ 6.15
RPS2-209ENST00000529806 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.13■■■■■ 6.1
RPS2-209ENST00000529806 SCRIBQ14160 1630 aa52.56■■■■■ 6
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RPS2-209ENST00000529806 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.44■■■■■ 5.83
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RPS2-209ENST00000529806 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.98■■■■■ 5.75
RPS2-209ENST00000529806 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.58■■■■■ 5.69
RPS2-209ENST00000529806 SMARCA4P51532 1647 aa50.24■■■■■ 5.63
RPS2-209ENST00000529806 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.16■■■■■ 5.62
RPS2-209ENST00000529806 SMARCA2P51531 1590 aa49.91■■■■■ 5.58
RPS2-209ENST00000529806 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.82■■■■■ 5.57
RPS2-209ENST00000529806 NCAPD3P42695 1498 aa49.78■■■■■ 5.56
RPS2-209ENST00000529806 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.75■■■■■ 5.56
RPS2-209ENST00000529806 HMGXB3Q12766 1538 aa49.68■■■■■ 5.54
RPS2-209ENST00000529806 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.66■■■■■ 5.54
RPS2-209ENST00000529806 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.54■■■■■ 5.52
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RPS2-209ENST00000529806 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.1■■■■■ 5.45
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RPS2-209ENST00000529806 NESP48681 1621 aa48.65■■■■■ 5.38
RPS2-209ENST00000529806 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.65■■■■■ 5.38
RPS2-209ENST00000529806 ERCC6Q03468 1493 aa48.61■■■■■ 5.37
RPS2-209ENST00000529806 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.33■■■■■ 5.33
RPS2-209ENST00000529806 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.31■■■■■ 5.32
RPS2-209ENST00000529806 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.24■■■■■ 5.31
RPS2-209ENST00000529806 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.1■■■■■ 5.29
RPS2-209ENST00000529806 PRDM2Q13029 1718 aa48.09■■■■■ 5.29
RPS2-209ENST00000529806 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.05■■■■■ 5.28
RPS2-209ENST00000529806 CUX2O14529 1486 aa48.05■■■■■ 5.28
RPS2-209ENST00000529806 CFTRP13569 1480 aa48.05■■■■■ 5.28
RPS2-209ENST00000529806 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
RPS2-209ENST00000529806 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.88■■■■■ 5.26
RPS2-209ENST00000529806 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.86■■■■■ 5.25
RPS2-209ENST00000529806 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.78■■■■■ 5.24
RPS2-209ENST00000529806 WDR62O43379 1518 aa47.63■■■■■ 5.22
RPS2-209ENST00000529806 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.35■■■■■ 5.17
RPS2-209ENST00000529806 ABCC8Q09428 1581 aa47.14■■■■■ 5.14
RPS2-209ENST00000529806 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.11■■■■■ 5.13
RPS2-209ENST00000529806 TOPBP1Q92547 1522 aa47.1■■■■■ 5.13
RPS2-209ENST00000529806 IFT140Q96RY7 1462 aa46.82■■■■■ 5.09
RPS2-209ENST00000529806 CUX1P39880 1505 aa46.71■■■■■ 5.07
RPS2-209ENST00000529806 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.68■■■■■ 5.06
RPS2-209ENST00000529806 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
RPS2-209ENST00000529806 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.59■■■■■ 5.05
RPS2-209ENST00000529806 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
RPS2-209ENST00000529806 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
RPS2-209ENST00000529806 SOGA1O94964 1423 aa46.46■■■■■ 5.03
RPS2-209ENST00000529806 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.46■■■■■ 5.03
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RPS2-209ENST00000529806 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.43■■■■■ 5.02
RPS2-209ENST00000529806 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.4■■■■■ 5.02not detected■■■■□ 25.1
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RPS2-209ENST00000529806 WDR97A6NE52 1622 aa46.35■■■■■ 5.01
RPS2-209ENST00000529806 SYNJ1O43426 1573 aa46.34■■■■■ 5.01
RPS2-209ENST00000529806 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.27■■■■■ 5not detected■■■■■ 54.3
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RPS2-209ENST00000529806 CHD1O14646 1710 aa46.06■■■■■ 4.96
RPS2-209ENST00000529806 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.03■■■■■ 4.96
RPS2-209ENST00000529806 GRIN2BQ13224 1484 aa45.98■■■■■ 4.95
RPS2-209ENST00000529806 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.97■■■■■ 4.95
RPS2-209ENST00000529806 OSCARQ8IYS5 282 aa45.96■■■■■ 4.95
RPS2-209ENST00000529806 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.93■■■■■ 4.94
RPS2-209ENST00000529806 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.88■■■■■ 4.94
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RPS2-209ENST00000529806 SYNJ2O15056 1496 aa45.68■■■■■ 4.9
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RPS2-209ENST00000529806 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.42■■■■■ 4.86
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RPS2-209ENST00000529806 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.39■■■■■ 4.86
RPS2-209ENST00000529806 GRIN2AQ12879 1464 aa45.39■■■■■ 4.86
RPS2-209ENST00000529806 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.39■■■■■ 4.86
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RPS2-209ENST00000529806 TRIM41Q8WV44 630 aa45.25■■■■■ 4.83
RPS2-209ENST00000529806 CEP170Q5SW79 1584 aa45.2■■■■■ 4.83
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RPS2-209ENST00000529806 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.94■■■■■ 4.78
RPS2-209ENST00000529806 SHROOM2Q13796 1616 aa44.91■■■■■ 4.78
RPS2-209ENST00000529806 ARAP1Q96P48 1450 aa44.9■■■■■ 4.78
RPS2-209ENST00000529806 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.79■■■■■ 4.76
RPS2-209ENST00000529806 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.73■■■■■ 4.75
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