RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567844.1

RNF166-209, Transcript of ring finger protein 166, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RNF166, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF166-209ENST00000567844 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.72■■■■■ 7.79
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RNF166-209ENST00000567844 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.99■■■■■ 6.23
RNF166-209ENST00000567844 NACADO15069 1562 aa53.72■■■■■ 6.19
RNF166-209ENST00000567844 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.59■■■■■ 6.17
RNF166-209ENST00000567844 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.12■■■■■ 6.09
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RNF166-209ENST00000567844 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.74■■■■■ 6.03
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RNF166-209ENST00000567844 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.65■■■■■ 6.02
RNF166-209ENST00000567844 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.44■■■■■ 5.99
RNF166-209ENST00000567844 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.35■■■■■ 5.97
RNF166-209ENST00000567844 SCRIBQ14160 1630 aa51.98■■■■■ 5.91
RNF166-209ENST00000567844 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.73■■■■■ 5.87
RNF166-209ENST00000567844 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.06■■■■■ 5.76
RNF166-209ENST00000567844 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.03■■■■■ 5.76
RNF166-209ENST00000567844 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.81■■■■■ 5.72
RNF166-209ENST00000567844 SMARCA4P51532 1647 aa49.61■■■■■ 5.53
RNF166-209ENST00000567844 NCAPD3P42695 1498 aa49.56■■■■■ 5.52
RNF166-209ENST00000567844 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.5■■■■■ 5.52
RNF166-209ENST00000567844 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.45■■■■■ 5.51
RNF166-209ENST00000567844 SMARCA2P51531 1590 aa49.42■■■■■ 5.5
RNF166-209ENST00000567844 HMGXB3Q12766 1538 aa49.28■■■■■ 5.48
RNF166-209ENST00000567844 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.11■■■■■ 5.45
RNF166-209ENST00000567844 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.09■■■■■ 5.45
RNF166-209ENST00000567844 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.09■■■■■ 5.45
RNF166-209ENST00000567844 ERCC6Q03468 1493 aa48.76■■■■■ 5.4
RNF166-209ENST00000567844 NESP48681 1621 aa48.65■■■■■ 5.38
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RNF166-209ENST00000567844 CUX2O14529 1486 aa48.45■■■■■ 5.35
RNF166-209ENST00000567844 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.4■■■■■ 5.34
RNF166-209ENST00000567844 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.27■■■■■ 5.32
RNF166-209ENST00000567844 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.11■■■■■ 5.29
RNF166-209ENST00000567844 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.1■■■■■ 5.29
RNF166-209ENST00000567844 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
RNF166-209ENST00000567844 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.05■■■■■ 5.28
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RNF166-209ENST00000567844 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.78■■■■■ 5.24
RNF166-209ENST00000567844 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.67■■■■■ 5.22
RNF166-209ENST00000567844 CFTRP13569 1480 aa47.65■■■■■ 5.22
RNF166-209ENST00000567844 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.59■■■■■ 5.21
RNF166-209ENST00000567844 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.58■■■■■ 5.21
RNF166-209ENST00000567844 WDR62O43379 1518 aa47.52■■■■■ 5.2
RNF166-209ENST00000567844 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.41■■■■■ 5.18
RNF166-209ENST00000567844 PRDM2Q13029 1718 aa47.25■■■■■ 5.15
RNF166-209ENST00000567844 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
RNF166-209ENST00000567844 TOPBP1Q92547 1522 aa46.73■■■■■ 5.07
RNF166-209ENST00000567844 ABCC8Q09428 1581 aa46.66■■■■■ 5.06
RNF166-209ENST00000567844 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.62■■■■■ 5.05
RNF166-209ENST00000567844 IFT140Q96RY7 1462 aa46.62■■■■■ 5.05
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RNF166-209ENST00000567844 SOGA1O94964 1423 aa46.08■■■■■ 4.97
RNF166-209ENST00000567844 TRIM41Q8WV44 630 aa45.98■■■■■ 4.95
RNF166-209ENST00000567844 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
RNF166-209ENST00000567844 WDR97A6NE52 1622 aa45.85■■■■■ 4.93
RNF166-209ENST00000567844 CHD1O14646 1710 aa45.83■■■■■ 4.93
RNF166-209ENST00000567844 FBLN2P98095 1184 aa45.75■■■■■ 4.91
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RNF166-209ENST00000567844 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.68■■■■■ 4.9
RNF166-209ENST00000567844 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.68■■■■■ 4.9
RNF166-209ENST00000567844 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.68■■■■■ 4.9
RNF166-209ENST00000567844 GRIN2BQ13224 1484 aa45.63■■■■■ 4.9
RNF166-209ENST00000567844 ARHGEF11O15085 1522 aa45.58■■■■■ 4.89
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RNF166-209ENST00000567844 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.56■■■■■ 4.88
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RNF166-209ENST00000567844 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.52■■■■■ 4.88
RNF166-209ENST00000567844 PBRM1Q86U86 1689 aa45.51■■■■■ 4.88
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RNF166-209ENST00000567844 SYNJ2O15056 1496 aa45.42■■■■■ 4.86
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RNF166-209ENST00000567844 ADAMTS12P58397 1594 aa45.11■■■■■ 4.81
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RNF166-209ENST00000567844 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.02■■■■■ 4.8
RNF166-209ENST00000567844 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.99■■■■■ 4.79
RNF166-209ENST00000567844 CEP170Q5SW79 1584 aa44.86■■■■■ 4.77
RNF166-209ENST00000567844 NUP160Q12769 1436 aa44.85■■■■■ 4.77
RNF166-209ENST00000567844 KIF27Q86VH2 1401 aa44.66■■■■■ 4.74
RNF166-209ENST00000567844 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.64■■■■■ 4.74
RNF166-209ENST00000567844 SHROOM2Q13796 1616 aa44.61■■■■■ 4.73
RNF166-209ENST00000567844 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.57■■■■■ 4.73
RNF166-209ENST00000567844 IGF1RP08069 1367 aa44.53■■■■■ 4.72
RNF166-209ENST00000567844 CUL7Q14999 1698 aa44.49■■■■■ 4.71
RNF166-209ENST00000567844 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.46■■■■■ 4.71
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