Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC4Q03721 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC4Q03721 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC4Q03721 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNC4Q03721 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNC4Q03721 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC4Q03721 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms