RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328649.10

CIB1-201, Transcript of calcium and integrin binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CIB1, Length 1,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1-201ENST00000328649 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.29■■■■■ 7.72
CIB1-201ENST00000328649 ABCC9O60706 1549 aa56.27■■■■■ 6.6
CIB1-201ENST00000328649 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.06■■■■■ 6.56
CIB1-201ENST00000328649 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.46■■■■■ 6.15
CIB1-201ENST00000328649 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.08■■■■■ 6.09
CIB1-201ENST00000328649 NACADO15069 1562 aa53.04■■■■■ 6.08
CIB1-201ENST00000328649 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.88■■■■■ 6.06
CIB1-201ENST00000328649 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.82■■■■■ 6.05
CIB1-201ENST00000328649 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.35■■■■■ 5.97
CIB1-201ENST00000328649 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.34■■■■■ 5.97
CIB1-201ENST00000328649 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.3■■■■■ 5.96
CIB1-201ENST00000328649 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.29■■■■■ 5.96
CIB1-201ENST00000328649 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.97■■■■■ 5.91
CIB1-201ENST00000328649 SCRIBQ14160 1630 aa51.27■■■■■ 5.8
CIB1-201ENST00000328649 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.19■■■■■ 5.79
CIB1-201ENST00000328649 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.85■■■■■ 5.73
CIB1-201ENST00000328649 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.72■■■■■ 5.71
CIB1-201ENST00000328649 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.68■■■■■ 5.7
CIB1-201ENST00000328649 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.02■■■■■ 5.44
CIB1-201ENST00000328649 SMARCA4P51532 1647 aa49.02■■■■■ 5.44
CIB1-201ENST00000328649 NCAPD3P42695 1498 aa48.98■■■■■ 5.43
CIB1-201ENST00000328649 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.92■■■■■ 5.42
CIB1-201ENST00000328649 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.83■■■■■ 5.41
CIB1-201ENST00000328649 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.78■■■■■ 5.4
CIB1-201ENST00000328649 SMARCA2P51531 1590 aa48.62■■■■■ 5.37
CIB1-201ENST00000328649 CUX2O14529 1486 aa48.61■■■■■ 5.37
CIB1-201ENST00000328649 HMGXB3Q12766 1538 aa48.58■■■■■ 5.37
CIB1-201ENST00000328649 ERCC6Q03468 1493 aa48.57■■■■■ 5.37
CIB1-201ENST00000328649 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.45■■■■■ 5.35
CIB1-201ENST00000328649 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.43■■■■■ 5.34
CIB1-201ENST00000328649 WIZO95785 1651 aa48.37■■■■■ 5.33
CIB1-201ENST00000328649 NESP48681 1621 aa48.29■■■■■ 5.32
CIB1-201ENST00000328649 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.28■■■■■ 5.32
CIB1-201ENST00000328649 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.92■■■■■ 5.26
CIB1-201ENST00000328649 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.87■■■■■ 5.25
CIB1-201ENST00000328649 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
CIB1-201ENST00000328649 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.81■■■■■ 5.24
CIB1-201ENST00000328649 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.7■■■■■ 5.23
CIB1-201ENST00000328649 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.62■■■■■ 5.21
CIB1-201ENST00000328649 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.46■■■■■ 5.19
CIB1-201ENST00000328649 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.29■■■■■ 5.16
CIB1-201ENST00000328649 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.22■■■■■ 5.15
CIB1-201ENST00000328649 WDR62O43379 1518 aa47.14■■■■■ 5.14
CIB1-201ENST00000328649 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.98■■■■■ 5.11
CIB1-201ENST00000328649 CFTRP13569 1480 aa46.91■■■■■ 5.1
CIB1-201ENST00000328649 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.91■■■■■ 5.1
CIB1-201ENST00000328649 PRDM2Q13029 1718 aa46.65■■■■■ 5.06
CIB1-201ENST00000328649 TRIM41Q8WV44 630 aa46.6■■■■■ 5.05
CIB1-201ENST00000328649 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
CIB1-201ENST00000328649 OSCARQ8IYS5 282 aa46.34■■■■■ 5.01
CIB1-201ENST00000328649 IFT140Q96RY7 1462 aa46.06■■■■■ 4.96
CIB1-201ENST00000328649 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.03■■■■■ 4.96
CIB1-201ENST00000328649 TOPBP1Q92547 1522 aa46.01■■■■■ 4.96
CIB1-201ENST00000328649 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.9■■■■■ 4.94
CIB1-201ENST00000328649 ABCC8Q09428 1581 aa45.89■■■■■ 4.94
CIB1-201ENST00000328649 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.81■■■■■ 4.92
CIB1-201ENST00000328649 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.81■■■■■ 4.92
CIB1-201ENST00000328649 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.81■■■■■ 4.92
CIB1-201ENST00000328649 CUX1P39880 1505 aa45.77■■■■■ 4.92
CIB1-201ENST00000328649 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
CIB1-201ENST00000328649 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.69■■■■■ 4.91
CIB1-201ENST00000328649 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
CIB1-201ENST00000328649 ARHGEF11O15085 1522 aa45.62■■■■■ 4.89
CIB1-201ENST00000328649 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.57■■■■■ 4.894e-7■■■■■ 57
CIB1-201ENST00000328649 SYNJ1O43426 1573 aa45.56■■■■■ 4.88
CIB1-201ENST00000328649 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.55■■■■■ 4.88
CIB1-201ENST00000328649 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.55■■■■■ 4.88
CIB1-201ENST00000328649 CHD1O14646 1710 aa45.51■■■■■ 4.88
CIB1-201ENST00000328649 TOP2BQ02880 1626 aa45.51■■■■■ 4.88
CIB1-201ENST00000328649 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.49■■■■■ 4.87
CIB1-201ENST00000328649 SOGA1O94964 1423 aa45.41■■■■■ 4.86
CIB1-201ENST00000328649 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.4■■■■■ 4.86
CIB1-201ENST00000328649 FBLN2P98095 1184 aa45.28■■■■■ 4.84
CIB1-201ENST00000328649 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.27■■■■■ 4.84
CIB1-201ENST00000328649 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.24■■■■■ 4.83
CIB1-201ENST00000328649 ARAP1Q96P48 1450 aa45.16■■■■■ 4.82
CIB1-201ENST00000328649 WDR97A6NE52 1622 aa45.15■■■■■ 4.82
CIB1-201ENST00000328649 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.09■■■■■ 4.81
CIB1-201ENST00000328649 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.08■■■■■ 4.81
CIB1-201ENST00000328649 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.97■■■■■ 4.79
CIB1-201ENST00000328649 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.96■■■■■ 4.79
CIB1-201ENST00000328649 GRIN2BQ13224 1484 aa44.93■■■■■ 4.78
CIB1-201ENST00000328649 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
CIB1-201ENST00000328649 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.88■■■■■ 4.78
CIB1-201ENST00000328649 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.86■■■■■ 4.77
CIB1-201ENST00000328649 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.84■■■■■ 4.77
CIB1-201ENST00000328649 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
CIB1-201ENST00000328649 SYNJ2O15056 1496 aa44.82■■■■■ 4.77
CIB1-201ENST00000328649 PBRM1Q86U86 1689 aa44.78■■■■■ 4.76
CIB1-201ENST00000328649 KIF27Q86VH2 1401 aa44.7■■■■■ 4.75
CIB1-201ENST00000328649 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.55■■■■■ 4.72
CIB1-201ENST00000328649 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.5■■■■■ 4.71
CIB1-201ENST00000328649 ADAMTS12P58397 1594 aa44.43■■■■■ 4.7
CIB1-201ENST00000328649 IGF1RP08069 1367 aa44.42■■■■■ 4.7
CIB1-201ENST00000328649 GRIN2AQ12879 1464 aa44.36■■■■■ 4.69
CIB1-201ENST00000328649 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.36■■■■■ 4.69
CIB1-201ENST00000328649 CUL7Q14999 1698 aa44.28■■■■■ 4.68
CIB1-201ENST00000328649 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.26■■■■■ 4.68
CIB1-201ENST00000328649 CEP170Q5SW79 1584 aa44.24■■■■■ 4.67
CIB1-201ENST00000328649 NUP160Q12769 1436 aa44.23■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms