Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
KCNC4Q03721 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KCNC4Q03721 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KCNC4Q03721 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KCNC4Q03721 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KCNC4Q03721 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KCNC4Q03721 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KCNC4Q03721 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KCNC4Q03721 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
KCNC4Q03721 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KCNC4Q03721 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KCNC4Q03721 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
KCNC4Q03721 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KCNC4Q03721 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KCNC4Q03721 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KCNC4Q03721 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KCNC4Q03721 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KCNC4Q03721 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCNC4Q03721 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KCNC4Q03721 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KCNC4Q03721 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KCNC4Q03721 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNC4Q03721 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNC4Q03721 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNC4Q03721 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KCNC4Q03721 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNC4Q03721 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNC4Q03721 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNC4Q03721 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNC4Q03721 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNC4Q03721 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNC4Q03721 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNC4Q03721 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNC4Q03721 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNC4Q03721 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNC4Q03721 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNC4Q03721 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNC4Q03721 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNC4Q03721 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNC4Q03721 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNC4Q03721 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNC4Q03721 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KCNC4Q03721 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNC4Q03721 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNC4Q03721 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNC4Q03721 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNC4Q03721 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNC4Q03721 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNC4Q03721 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNC4Q03721 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNC4Q03721 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNC4Q03721 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNC4Q03721 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNC4Q03721 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNC4Q03721 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNC4Q03721 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNC4Q03721 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNC4Q03721 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNC4Q03721 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNC4Q03721 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNC4Q03721 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNC4Q03721 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNC4Q03721 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNC4Q03721 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNC4Q03721 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNC4Q03721 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNC4Q03721 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNC4Q03721 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNC4Q03721 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNC4Q03721 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNC4Q03721 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNC4Q03721 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNC4Q03721 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNC4Q03721 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNC4Q03721 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNC4Q03721 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNC4Q03721 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNC4Q03721 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNC4Q03721 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNC4Q03721 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNC4Q03721 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNC4Q03721 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNC4Q03721 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNC4Q03721 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNC4Q03721 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNC4Q03721 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNC4Q03721 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNC4Q03721 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNC4Q03721 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNC4Q03721 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNC4Q03721 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNC4Q03721 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNC4Q03721 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNC4Q03721 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNC4Q03721 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNC4Q03721 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNC4Q03721 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNC4Q03721 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNC4Q03721 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNC4Q03721 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms