RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526377.1

AP000911.3-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AP000911.3, Length 1,130 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000911.3-201ENST00000526377 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.5■■■■■ 7.6
AP000911.3-201ENST00000526377 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.15■■■■■ 6.58
AP000911.3-201ENST00000526377 ABCC9O60706 1549 aa55.92■■■■■ 6.54
AP000911.3-201ENST00000526377 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.44■■■■■ 6.14
AP000911.3-201ENST00000526377 NACADO15069 1562 aa53.1■■■■■ 6.09
AP000911.3-201ENST00000526377 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.68■■■■■ 6.02
AP000911.3-201ENST00000526377 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.44■■■■■ 5.98
AP000911.3-201ENST00000526377 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.3■■■■■ 5.96
AP000911.3-201ENST00000526377 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.03■■■■■ 5.92
AP000911.3-201ENST00000526377 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.03■■■■■ 5.92
AP000911.3-201ENST00000526377 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.8■■■■■ 5.88
AP000911.3-201ENST00000526377 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.74■■■■■ 5.87
AP000911.3-201ENST00000526377 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.7■■■■■ 5.87
AP000911.3-201ENST00000526377 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.31■■■■■ 5.8
AP000911.3-201ENST00000526377 SCRIBQ14160 1630 aa50.99■■■■■ 5.75
AP000911.3-201ENST00000526377 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.56■■■■■ 5.68
AP000911.3-201ENST00000526377 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.5■■■■■ 5.67
AP000911.3-201ENST00000526377 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.46■■■■■ 5.67
AP000911.3-201ENST00000526377 NCAPD3P42695 1498 aa48.98■■■■■ 5.43
AP000911.3-201ENST00000526377 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.76■■■■■ 5.4
AP000911.3-201ENST00000526377 SMARCA2P51531 1590 aa48.75■■■■■ 5.39
AP000911.3-201ENST00000526377 SMARCA4P51532 1647 aa48.72■■■■■ 5.39
AP000911.3-201ENST00000526377 HMGXB3Q12766 1538 aa48.63■■■■■ 5.38
AP000911.3-201ENST00000526377 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.58■■■■■ 5.37
AP000911.3-201ENST00000526377 ERCC6Q03468 1493 aa48.42■■■■■ 5.34
AP000911.3-201ENST00000526377 CUX2O14529 1486 aa48.37■■■■■ 5.33
AP000911.3-201ENST00000526377 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
AP000911.3-201ENST00000526377 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.32■■■■■ 5.33
AP000911.3-201ENST00000526377 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.21■■■■■ 5.31
AP000911.3-201ENST00000526377 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.06■■■■■ 5.28
AP000911.3-201ENST00000526377 NESP48681 1621 aa48■■■■■ 5.27
AP000911.3-201ENST00000526377 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.89■■■■■ 5.26
AP000911.3-201ENST00000526377 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.65■■■■■ 5.22
AP000911.3-201ENST00000526377 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.59■■■■■ 5.21
AP000911.3-201ENST00000526377 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.48■■■■■ 5.19
AP000911.3-201ENST00000526377 WIZO95785 1651 aa47.48■■■■■ 5.19
AP000911.3-201ENST00000526377 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.44■■■■■ 5.18
AP000911.3-201ENST00000526377 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.15■■■■■ 5.14
AP000911.3-201ENST00000526377 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.13■■■■■ 5.13
AP000911.3-201ENST00000526377 WDR62O43379 1518 aa47.02■■■■■ 5.12
AP000911.3-201ENST00000526377 CEP164Q9UPV0 1460 aa47■■■■■ 5.11
AP000911.3-201ENST00000526377 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47■■■■■ 5.11
AP000911.3-201ENST00000526377 CFTRP13569 1480 aa46.94■■■■■ 5.1
AP000911.3-201ENST00000526377 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.9■■■■■ 5.1
AP000911.3-201ENST00000526377 PRDM2Q13029 1718 aa46.48■■■■■ 5.03
AP000911.3-201ENST00000526377 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.03
AP000911.3-201ENST00000526377 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.4■■■■■ 5.02
AP000911.3-201ENST00000526377 OSCARQ8IYS5 282 aa46.16■■■■■ 4.98
AP000911.3-201ENST00000526377 ABCC8Q09428 1581 aa46.1■■■■■ 4.97
AP000911.3-201ENST00000526377 IFT140Q96RY7 1462 aa46.08■■■■■ 4.97
AP000911.3-201ENST00000526377 TRIM41Q8WV44 630 aa46.03■■■■■ 4.96
AP000911.3-201ENST00000526377 TOPBP1Q92547 1522 aa46■■■■■ 4.95
AP000911.3-201ENST00000526377 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.88■■■■■ 4.94
AP000911.3-201ENST00000526377 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.82■■■■■ 4.92
AP000911.3-201ENST00000526377 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
AP000911.3-201ENST00000526377 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.56■■■■■ 4.88
AP000911.3-201ENST00000526377 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.53■■■■■ 4.88
AP000911.3-201ENST00000526377 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.45■■■■■ 4.87
AP000911.3-201ENST00000526377 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.42■■■■■ 4.86
AP000911.3-201ENST00000526377 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.42■■■■■ 4.86
AP000911.3-201ENST00000526377 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.42■■■■■ 4.86
AP000911.3-201ENST00000526377 SOGA1O94964 1423 aa45.37■■■■■ 4.85
AP000911.3-201ENST00000526377 ARHGEF11O15085 1522 aa45.31■■■■■ 4.84
AP000911.3-201ENST00000526377 WDR97A6NE52 1622 aa45.31■■■■■ 4.84
AP000911.3-201ENST00000526377 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.29■■■■■ 4.84
AP000911.3-201ENST00000526377 CHD1O14646 1710 aa45.27■■■■■ 4.84
AP000911.3-201ENST00000526377 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.24■■■■■ 4.83
AP000911.3-201ENST00000526377 FBLN2P98095 1184 aa45.21■■■■■ 4.83
AP000911.3-201ENST00000526377 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
AP000911.3-201ENST00000526377 CUX1P39880 1505 aa45.16■■■■■ 4.82
AP000911.3-201ENST00000526377 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.04■■■■■ 4.8
AP000911.3-201ENST00000526377 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.04■■■■■ 4.8
AP000911.3-201ENST00000526377 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.03■■■■■ 4.8
AP000911.3-201ENST00000526377 GRIN2BQ13224 1484 aa45.01■■■■■ 4.8
AP000911.3-201ENST00000526377 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.98■■■■■ 4.79
AP000911.3-201ENST00000526377 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.96■■■■■ 4.79
AP000911.3-201ENST00000526377 SYNJ1O43426 1573 aa44.88■■■■■ 4.78
AP000911.3-201ENST00000526377 SYNJ2O15056 1496 aa44.85■■■■■ 4.77
AP000911.3-201ENST00000526377 ARAP1Q96P48 1450 aa44.83■■■■■ 4.77
AP000911.3-201ENST00000526377 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.82■■■■■ 4.77
AP000911.3-201ENST00000526377 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.8■■■■■ 4.76
AP000911.3-201ENST00000526377 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.8■■■■■ 4.76
AP000911.3-201ENST00000526377 PBRM1Q86U86 1689 aa44.75■■■■■ 4.75
AP000911.3-201ENST00000526377 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.68■■■■■ 4.74
AP000911.3-201ENST00000526377 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.67■■■■■ 4.74
AP000911.3-201ENST00000526377 TOP2BQ02880 1626 aa44.54■■■■■ 4.72
AP000911.3-201ENST00000526377 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.53■■■■■ 4.72
AP000911.3-201ENST00000526377 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.51■■■■■ 4.72
AP000911.3-201ENST00000526377 GRIN2AQ12879 1464 aa44.39■■■■■ 4.7
AP000911.3-201ENST00000526377 ADAMTS12P58397 1594 aa44.33■■■■■ 4.69
AP000911.3-201ENST00000526377 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.29■■■■■ 4.68
AP000911.3-201ENST00000526377 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.28■■■■■ 4.68
AP000911.3-201ENST00000526377 NUP160Q12769 1436 aa44.24■■■■■ 4.67
AP000911.3-201ENST00000526377 CEP170Q5SW79 1584 aa44.15■■■■■ 4.66
AP000911.3-201ENST00000526377 SHROOM2Q13796 1616 aa44.02■■■■■ 4.64
AP000911.3-201ENST00000526377 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.96■■■■■ 4.63
AP000911.3-201ENST00000526377 JPH4Q96JJ6 628 aa43.8■■■■■ 4.6
AP000911.3-201ENST00000526377 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
AP000911.3-201ENST00000526377 KIF27Q86VH2 1401 aa43.74■■■■■ 4.59
AP000911.3-201ENST00000526377 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.7■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms