RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428034.1

CLEC3B-202, Transcript of C-type lectin domain family 3 member B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLEC3B, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3B-202ENST00000428034 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.45■■■■■ 7.75
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CLEC3B-202ENST00000428034 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.71■■■■■ 6.19
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CLEC3B-202ENST00000428034 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.35■■■■■ 5.17
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CLEC3B-202ENST00000428034 TOPBP1Q92547 1522 aa46.5■■■■■ 5.03
CLEC3B-202ENST00000428034 IFT140Q96RY7 1462 aa46.4■■■■■ 5.02
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CLEC3B-202ENST00000428034 WDR97A6NE52 1622 aa45.65■■■■■ 4.9
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CLEC3B-202ENST00000428034 GRIN2BQ13224 1484 aa45.43■■■■■ 4.86
CLEC3B-202ENST00000428034 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.39■■■■■ 4.86
CLEC3B-202ENST00000428034 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.38■■■■■ 4.86
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CLEC3B-202ENST00000428034 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.37■■■■■ 4.85
CLEC3B-202ENST00000428034 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.35■■■■■ 4.85
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CLEC3B-202ENST00000428034 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.31■■■■■ 4.84
CLEC3B-202ENST00000428034 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.3■■■■■ 4.84
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CLEC3B-202ENST00000428034 NUP160Q12769 1436 aa44.67■■■■■ 4.74
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CLEC3B-202ENST00000428034 SHROOM2Q13796 1616 aa44.37■■■■■ 4.69
CLEC3B-202ENST00000428034 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.35■■■■■ 4.69
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CLEC3B-202ENST00000428034 CUL7Q14999 1698 aa44.27■■■■■ 4.68
CLEC3B-202ENST00000428034 JPH4Q96JJ6 628 aa44.26■■■■■ 4.68
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