RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.7■■■■■ 7.63
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PPP4R4-202ENST00000328839 ABCC9O60706 1549 aa56.33■■■■■ 6.61
PPP4R4-202ENST00000328839 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.61■■■■■ 6.17
PPP4R4-202ENST00000328839 NACADO15069 1562 aa53.2■■■■■ 6.11
PPP4R4-202ENST00000328839 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.04■■■■■ 6.08
PPP4R4-202ENST00000328839 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.72■■■■■ 6.03
PPP4R4-202ENST00000328839 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.48■■■■■ 5.99
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PPP4R4-202ENST00000328839 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.4■■■■■ 5.98
PPP4R4-202ENST00000328839 BICRAQ9NZM4 1560 aa52■■■■■ 5.92
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PPP4R4-202ENST00000328839 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.88■■■■■ 5.74
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PPP4R4-202ENST00000328839 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.71■■■■■ 5.71
PPP4R4-202ENST00000328839 NCAPD3P42695 1498 aa49.06■■■■■ 5.44
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PPP4R4-202ENST00000328839 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.95■■■■■ 5.43
PPP4R4-202ENST00000328839 SMARCA2P51531 1590 aa48.85■■■■■ 5.41
PPP4R4-202ENST00000328839 HMGXB3Q12766 1538 aa48.76■■■■■ 5.4
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PPP4R4-202ENST00000328839 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.54■■■■■ 5.36
PPP4R4-202ENST00000328839 CUX2O14529 1486 aa48.48■■■■■ 5.35
PPP4R4-202ENST00000328839 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.42■■■■■ 5.34
PPP4R4-202ENST00000328839 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.4■■■■■ 5.34
PPP4R4-202ENST00000328839 NESP48681 1621 aa48.38■■■■■ 5.34
PPP4R4-202ENST00000328839 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.34■■■■■ 5.33
PPP4R4-202ENST00000328839 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.03■■■■■ 5.28
PPP4R4-202ENST00000328839 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
PPP4R4-202ENST00000328839 WIZO95785 1651 aa47.83■■■■■ 5.25
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.83■■■■■ 5.25
PPP4R4-202ENST00000328839 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.73■■■■■ 5.23
PPP4R4-202ENST00000328839 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.6■■■■■ 5.21
PPP4R4-202ENST00000328839 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.33■■■■■ 5.17
PPP4R4-202ENST00000328839 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.3■■■■■ 5.16
PPP4R4-202ENST00000328839 WDR62O43379 1518 aa47.21■■■■■ 5.15
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PPP4R4-202ENST00000328839 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.17■■■■■ 5.14
PPP4R4-202ENST00000328839 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.1■■■■■ 5.13
PPP4R4-202ENST00000328839 CFTRP13569 1480 aa47.05■■■■■ 5.12
PPP4R4-202ENST00000328839 PRDM2Q13029 1718 aa46.75■■■■■ 5.07
PPP4R4-202ENST00000328839 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.71■■■■■ 5.07
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.62■■■■■ 5.05
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM41Q8WV44 630 aa46.42■■■■■ 5.02
PPP4R4-202ENST00000328839 OSCARQ8IYS5 282 aa46.27■■■■■ 5
PPP4R4-202ENST00000328839 TOPBP1Q92547 1522 aa46.22■■■■■ 4.99
PPP4R4-202ENST00000328839 IFT140Q96RY7 1462 aa46.19■■■■■ 4.99
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.13■■■■■ 4.98
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCC8Q09428 1581 aa46.09■■■■■ 4.97
PPP4R4-202ENST00000328839 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.06■■■■■ 4.96
PPP4R4-202ENST00000328839 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.94
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PPP4R4-202ENST00000328839 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.74■■■■■ 4.91
PPP4R4-202ENST00000328839 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.74■■■■■ 4.91
PPP4R4-202ENST00000328839 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
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PPP4R4-202ENST00000328839 CHD1O14646 1710 aa45.65■■■■■ 4.9
PPP4R4-202ENST00000328839 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.59■■■■■ 4.89
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGEF11O15085 1522 aa45.57■■■■■ 4.88
PPP4R4-202ENST00000328839 SOGA1O94964 1423 aa45.52■■■■■ 4.88
PPP4R4-202ENST00000328839 FBLN2P98095 1184 aa45.49■■■■■ 4.87
PPP4R4-202ENST00000328839 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.48■■■■■ 4.87
PPP4R4-202ENST00000328839 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
PPP4R4-202ENST00000328839 CUX1P39880 1505 aa45.43■■■■■ 4.86
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PPP4R4-202ENST00000328839 WDR97A6NE52 1622 aa45.33■■■■■ 4.85
PPP4R4-202ENST00000328839 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.29■■■■■ 4.84
PPP4R4-202ENST00000328839 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.23■■■■■ 4.83
PPP4R4-202ENST00000328839 GRIN2BQ13224 1484 aa45.13■■■■■ 4.82
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PPP4R4-202ENST00000328839 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
PPP4R4-202ENST00000328839 ARAP1Q96P48 1450 aa45.1■■■■■ 4.81
PPP4R4-202ENST00000328839 PBRM1Q86U86 1689 aa45.07■■■■■ 4.81
PPP4R4-202ENST00000328839 SYNJ1O43426 1573 aa45.04■■■■■ 4.8
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PPP4R4-202ENST00000328839 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.98■■■■■ 4.79
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.92■■■■■ 4.78
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.9■■■■■ 4.78
PPP4R4-202ENST00000328839 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.78■■■■■ 4.76
PPP4R4-202ENST00000328839 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.75■■■■■ 4.76
PPP4R4-202ENST00000328839 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.74■■■■■ 4.75
PPP4R4-202ENST00000328839 TOP2BQ02880 1626 aa44.72■■■■■ 4.75
PPP4R4-202ENST00000328839 ADAMTS12P58397 1594 aa44.57■■■■■ 4.73
PPP4R4-202ENST00000328839 GRIN2AQ12879 1464 aa44.56■■■■■ 4.72
PPP4R4-202ENST00000328839 CEP170Q5SW79 1584 aa44.43■■■■■ 4.7
PPP4R4-202ENST00000328839 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.4■■■■■ 4.7
PPP4R4-202ENST00000328839 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.38■■■■■ 4.69
PPP4R4-202ENST00000328839 NUP160Q12769 1436 aa44.37■■■■■ 4.69
PPP4R4-202ENST00000328839 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.35■■■■■ 4.69
PPP4R4-202ENST00000328839 SHROOM2Q13796 1616 aa44.21■■■■■ 4.67
PPP4R4-202ENST00000328839 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
PPP4R4-202ENST00000328839 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.94■■■■■ 4.63
PPP4R4-202ENST00000328839 JPH4Q96JJ6 628 aa43.92■■■■■ 4.62
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF27Q86VH2 1401 aa43.82■■■■■ 4.61
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