Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX13Q9UN79 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOX13Q9UN79 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOX13Q9UN79 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX13Q9UN79 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SOX13Q9UN79 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SOX13Q9UN79 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX13Q9UN79 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX13Q9UN79 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX13Q9UN79 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX13Q9UN79 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX13Q9UN79 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX13Q9UN79 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX13Q9UN79 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX13Q9UN79 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX13Q9UN79 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX13Q9UN79 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms