Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL11Q9NVR0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL11Q9NVR0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL11Q9NVR0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL11Q9NVR0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHL11Q9NVR0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHL11Q9NVR0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHL11Q9NVR0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHL11Q9NVR0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL11Q9NVR0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL11Q9NVR0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL11Q9NVR0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL11Q9NVR0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL11Q9NVR0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL11Q9NVR0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL11Q9NVR0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL11Q9NVR0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL11Q9NVR0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL11Q9NVR0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL11Q9NVR0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL11Q9NVR0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KLHL11Q9NVR0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KLHL11Q9NVR0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms