RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255681.6

MACROD1-201, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MACROD1, Length 1,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-201ENST00000255681 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.5■■■■■ 8.56
MACROD1-201ENST00000255681 ABCC9O60706 1549 aa62.18■■■■■ 7.54
MACROD1-201ENST00000255681 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.66■■■■■ 7.46
MACROD1-201ENST00000255681 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.95■■■■■ 7.03
MACROD1-201ENST00000255681 DNAJC5BQ9UF47 199 aa58.84■■■■■ 7.01
MACROD1-201ENST00000255681 NACADO15069 1562 aa58.42■■■■■ 6.94
MACROD1-201ENST00000255681 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.02■■■■■ 6.88
MACROD1-201ENST00000255681 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57.83■■■■■ 6.85
MACROD1-201ENST00000255681 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.64■■■■■ 6.82
MACROD1-201ENST00000255681 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.46■■■■■ 6.79
MACROD1-201ENST00000255681 BICRAQ9NZM4 1560 aa57.29■■■■■ 6.76
MACROD1-201ENST00000255681 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.65■■■■■ 6.66
MACROD1-201ENST00000255681 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.54■■■■■ 6.64
MACROD1-201ENST00000255681 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.42■■■■■ 6.62
MACROD1-201ENST00000255681 SCRIBQ14160 1630 aa56.15■■■■■ 6.58
MACROD1-201ENST00000255681 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.15■■■■■ 6.58
MACROD1-201ENST00000255681 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.07■■■■■ 6.57
MACROD1-201ENST00000255681 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.9■■■■■ 6.54
MACROD1-201ENST00000255681 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.37■■■■■ 6.29
MACROD1-201ENST00000255681 NCAPD3P42695 1498 aa53.97■■■■■ 6.23
MACROD1-201ENST00000255681 CUX2O14529 1486 aa53.79■■■■■ 6.2
MACROD1-201ENST00000255681 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.73■■■■■ 6.19
MACROD1-201ENST00000255681 ERCC6Q03468 1493 aa53.7■■■■■ 6.19
MACROD1-201ENST00000255681 SMARCA4P51532 1647 aa53.53■■■■■ 6.16
MACROD1-201ENST00000255681 SMARCA2P51531 1590 aa53.53■■■■■ 6.16
MACROD1-201ENST00000255681 HMGXB3Q12766 1538 aa53.5■■■■■ 6.15
MACROD1-201ENST00000255681 NESP48681 1621 aa53.29■■■■■ 6.12
MACROD1-201ENST00000255681 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.19■■■■■ 6.1
MACROD1-201ENST00000255681 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.16■■■■■ 6.1
MACROD1-201ENST00000255681 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.03■■■■■ 6.08
MACROD1-201ENST00000255681 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.83■■■■■ 6.05
MACROD1-201ENST00000255681 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.81■■■■■ 6.04
MACROD1-201ENST00000255681 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.79■■■■■ 6.04
MACROD1-201ENST00000255681 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.56■■■■■ 6
MACROD1-201ENST00000255681 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.52■■■■■ 6
MACROD1-201ENST00000255681 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.3■■■■■ 5.96
MACROD1-201ENST00000255681 WIZO95785 1651 aa52.12■■■■■ 5.93
MACROD1-201ENST00000255681 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.1■■■■■ 5.93
MACROD1-201ENST00000255681 WDR62O43379 1518 aa51.99■■■■■ 5.91
MACROD1-201ENST00000255681 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.79■■■■■ 5.88
MACROD1-201ENST00000255681 TRIM41Q8WV44 630 aa51.75■■■■■ 5.87
MACROD1-201ENST00000255681 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.7■■■■■ 5.87
MACROD1-201ENST00000255681 CFTRP13569 1480 aa51.61■■■■■ 5.85
MACROD1-201ENST00000255681 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.51■■■■■ 5.84
MACROD1-201ENST00000255681 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.41■■■■■ 5.82
MACROD1-201ENST00000255681 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.33■■■■■ 5.81
MACROD1-201ENST00000255681 OSCARQ8IYS5 282 aa51.27■■■■■ 5.8
MACROD1-201ENST00000255681 PRDM2Q13029 1718 aa51.01■■■■■ 5.76
MACROD1-201ENST00000255681 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.86■■■■■ 5.73
MACROD1-201ENST00000255681 IFT140Q96RY7 1462 aa50.78■■■■■ 5.72
MACROD1-201ENST00000255681 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.77■■■■■ 5.72
MACROD1-201ENST00000255681 TOPBP1Q92547 1522 aa50.67■■■■■ 5.7
MACROD1-201ENST00000255681 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.65■■■■■ 5.7
MACROD1-201ENST00000255681 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.65■■■■■ 5.7
MACROD1-201ENST00000255681 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.65■■■■■ 5.7
MACROD1-201ENST00000255681 ABCC8Q09428 1581 aa50.51■■■■■ 5.68
MACROD1-201ENST00000255681 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.44■■■■■ 5.67
MACROD1-201ENST00000255681 ARHGEF11O15085 1522 aa50.44■■■■■ 5.67
MACROD1-201ENST00000255681 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.43■■■■■ 5.66
MACROD1-201ENST00000255681 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.27■■■■■ 5.64
MACROD1-201ENST00000255681 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.26■■■■■ 5.64
MACROD1-201ENST00000255681 CHD1O14646 1710 aa50.16■■■■■ 5.62
MACROD1-201ENST00000255681 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.12■■■■■ 5.61
MACROD1-201ENST00000255681 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.11■■■■■ 5.61
MACROD1-201ENST00000255681 FBLN2P98095 1184 aa50■■■■■ 5.59
MACROD1-201ENST00000255681 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.96■■■■■ 5.59
MACROD1-201ENST00000255681 ARAP1Q96P48 1450 aa49.91■■■■■ 5.58
MACROD1-201ENST00000255681 SOGA1O94964 1423 aa49.88■■■■■ 5.58
MACROD1-201ENST00000255681 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.86■■■■■ 5.57
MACROD1-201ENST00000255681 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.73■■■■■ 5.55
MACROD1-201ENST00000255681 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.7■■■■■ 5.55
MACROD1-201ENST00000255681 TRHP20396 242 aaPredicted RBP49.69■■■■■ 5.55
MACROD1-201ENST00000255681 WDR97A6NE52 1622 aa49.68■■■■■ 5.54
MACROD1-201ENST00000255681 CUX1P39880 1505 aa49.62■■■■■ 5.53
MACROD1-201ENST00000255681 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.6■■■■■ 5.53
MACROD1-201ENST00000255681 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.55■■■■■ 5.52
MACROD1-201ENST00000255681 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.55■■■■■ 5.52
MACROD1-201ENST00000255681 GRIN2BQ13224 1484 aa49.5■■■■■ 5.51
MACROD1-201ENST00000255681 SYNJ1O43426 1573 aa49.49■■■■■ 5.51
MACROD1-201ENST00000255681 SYNJ2O15056 1496 aa49.39■■■■■ 5.5
MACROD1-201ENST00000255681 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.26■■■■■ 5.48
MACROD1-201ENST00000255681 PBRM1Q86U86 1689 aa49.26■■■■■ 5.48
MACROD1-201ENST00000255681 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.14■■■■■ 5.46
MACROD1-201ENST00000255681 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.11■■■■■ 5.45
MACROD1-201ENST00000255681 GRIN2AQ12879 1464 aa48.86■■■■■ 5.41
MACROD1-201ENST00000255681 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.84■■■■■ 5.41
MACROD1-201ENST00000255681 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.83■■■■■ 5.413e-6■■■■■ 50.1
MACROD1-201ENST00000255681 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.81■■■■■ 5.4
MACROD1-201ENST00000255681 ADAMTS12P58397 1594 aa48.77■■■■■ 5.4
MACROD1-201ENST00000255681 NUP160Q12769 1436 aa48.74■■■■■ 5.39
MACROD1-201ENST00000255681 CEP170Q5SW79 1584 aa48.73■■■■■ 5.39
MACROD1-201ENST00000255681 TOP2BQ02880 1626 aa48.68■■■■■ 5.38
MACROD1-201ENST00000255681 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.68■■■■■ 5.38
MACROD1-201ENST00000255681 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.61■■■■■ 5.37
MACROD1-201ENST00000255681 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP48.6■■■■■ 5.37
MACROD1-201ENST00000255681 SHROOM2Q13796 1616 aa48.58■■■■■ 5.37
MACROD1-201ENST00000255681 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.51■■■■■ 5.36
MACROD1-201ENST00000255681 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.31■■■■■ 5.32
MACROD1-201ENST00000255681 JPH4Q96JJ6 628 aa48.24■■■■■ 5.31
MACROD1-201ENST00000255681 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.19■■■■■ 5.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms