Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KLHL11Q9NVR0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KLHL11Q9NVR0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
KLHL11Q9NVR0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KLHL11Q9NVR0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KLHL11Q9NVR0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KLHL11Q9NVR0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KLHL11Q9NVR0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KLHL11Q9NVR0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KLHL11Q9NVR0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KLHL11Q9NVR0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KLHL11Q9NVR0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KLHL11Q9NVR0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KLHL11Q9NVR0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KLHL11Q9NVR0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KLHL11Q9NVR0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KLHL11Q9NVR0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KLHL11Q9NVR0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KLHL11Q9NVR0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KLHL11Q9NVR0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KLHL11Q9NVR0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KLHL11Q9NVR0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KLHL11Q9NVR0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KLHL11Q9NVR0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KLHL11Q9NVR0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KLHL11Q9NVR0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
KLHL11Q9NVR0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KLHL11Q9NVR0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KLHL11Q9NVR0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KLHL11Q9NVR0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KLHL11Q9NVR0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KLHL11Q9NVR0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KLHL11Q9NVR0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
KLHL11Q9NVR0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KLHL11Q9NVR0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KLHL11Q9NVR0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KLHL11Q9NVR0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KLHL11Q9NVR0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KLHL11Q9NVR0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KLHL11Q9NVR0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KLHL11Q9NVR0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KLHL11Q9NVR0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KLHL11Q9NVR0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KLHL11Q9NVR0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KLHL11Q9NVR0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KLHL11Q9NVR0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
KLHL11Q9NVR0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
KLHL11Q9NVR0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KLHL11Q9NVR0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KLHL11Q9NVR0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KLHL11Q9NVR0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KLHL11Q9NVR0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KLHL11Q9NVR0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KLHL11Q9NVR0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KLHL11Q9NVR0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KLHL11Q9NVR0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KLHL11Q9NVR0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
KLHL11Q9NVR0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KLHL11Q9NVR0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KLHL11Q9NVR0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KLHL11Q9NVR0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KLHL11Q9NVR0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KLHL11Q9NVR0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KLHL11Q9NVR0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KLHL11Q9NVR0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KLHL11Q9NVR0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KLHL11Q9NVR0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KLHL11Q9NVR0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KLHL11Q9NVR0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KLHL11Q9NVR0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KLHL11Q9NVR0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KLHL11Q9NVR0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KLHL11Q9NVR0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KLHL11Q9NVR0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KLHL11Q9NVR0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KLHL11Q9NVR0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KLHL11Q9NVR0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KLHL11Q9NVR0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KLHL11Q9NVR0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
KLHL11Q9NVR0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KLHL11Q9NVR0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KLHL11Q9NVR0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KLHL11Q9NVR0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KLHL11Q9NVR0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KLHL11Q9NVR0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KLHL11Q9NVR0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KLHL11Q9NVR0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KLHL11Q9NVR0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KLHL11Q9NVR0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
KLHL11Q9NVR0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KLHL11Q9NVR0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHL11Q9NVR0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHL11Q9NVR0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHL11Q9NVR0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHL11Q9NVR0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KLHL11Q9NVR0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHL11Q9NVR0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KLHL11Q9NVR0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KLHL11Q9NVR0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KLHL11Q9NVR0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms