RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360476.7

NMB-201, Transcript of neuromedin B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NMB, Length 1,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMB-201ENST00000360476 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.25■■■■■ 8.52
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NMB-201ENST00000360476 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.17■■■■■ 6.9
NMB-201ENST00000360476 NACADO15069 1562 aa57.78■■■■■ 6.84
NMB-201ENST00000360476 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.42■■■■■ 6.78
NMB-201ENST00000360476 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.17■■■■■ 6.74
NMB-201ENST00000360476 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.16■■■■■ 6.74
NMB-201ENST00000360476 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.97■■■■■ 6.71
NMB-201ENST00000360476 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.84■■■■■ 6.69
NMB-201ENST00000360476 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.63■■■■■ 6.66
NMB-201ENST00000360476 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.6■■■■■ 6.65
NMB-201ENST00000360476 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.33■■■■■ 6.61
NMB-201ENST00000360476 SCRIBQ14160 1630 aa55.9■■■■■ 6.54
NMB-201ENST00000360476 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.64■■■■■ 6.5
NMB-201ENST00000360476 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.25■■■■■ 6.44
NMB-201ENST00000360476 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.13■■■■■ 6.42
NMB-201ENST00000360476 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.98■■■■■ 6.39
NMB-201ENST00000360476 SMARCA4P51532 1647 aa53.3■■■■■ 6.12
NMB-201ENST00000360476 NCAPD3P42695 1498 aa53.29■■■■■ 6.12
NMB-201ENST00000360476 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.22■■■■■ 6.11
NMB-201ENST00000360476 SMARCA2P51531 1590 aa53.06■■■■■ 6.09
NMB-201ENST00000360476 HMGXB3Q12766 1538 aa53■■■■■ 6.07
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NMB-201ENST00000360476 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.71■■■■■ 6.03
NMB-201ENST00000360476 ERCC6Q03468 1493 aa52.68■■■■■ 6.02
NMB-201ENST00000360476 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.66■■■■■ 6.02
NMB-201ENST00000360476 NESP48681 1621 aa52.58■■■■■ 6.01
NMB-201ENST00000360476 CUX2O14529 1486 aa52.51■■■■■ 6
NMB-201ENST00000360476 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.26■■■■■ 5.96
NMB-201ENST00000360476 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.14■■■■■ 5.94
NMB-201ENST00000360476 WIZO95785 1651 aa52.1■■■■■ 5.93
NMB-201ENST00000360476 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.07■■■■■ 5.93
NMB-201ENST00000360476 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.02■■■■■ 5.92
NMB-201ENST00000360476 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.72■■■■■ 5.87
NMB-201ENST00000360476 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.67■■■■■ 5.86
NMB-201ENST00000360476 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.53■■■■■ 5.84
NMB-201ENST00000360476 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.38■■■■■ 5.82
NMB-201ENST00000360476 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.37■■■■■ 5.81
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NMB-201ENST00000360476 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.2■■■■■ 5.79
NMB-201ENST00000360476 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.16■■■■■ 5.78
NMB-201ENST00000360476 CFTRP13569 1480 aa51.16■■■■■ 5.78
NMB-201ENST00000360476 PRDM2Q13029 1718 aa50.92■■■■■ 5.74
NMB-201ENST00000360476 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.81■■■■■ 5.72
NMB-201ENST00000360476 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.74■■■■■ 5.71
NMB-201ENST00000360476 TOPBP1Q92547 1522 aa50.25■■■■■ 5.63
NMB-201ENST00000360476 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.16■■■■■ 5.62
NMB-201ENST00000360476 IFT140Q96RY7 1462 aa50.14■■■■■ 5.62
NMB-201ENST00000360476 TRIM41Q8WV44 630 aa50.11■■■■■ 5.61
NMB-201ENST00000360476 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.09■■■■■ 5.61
NMB-201ENST00000360476 OSCARQ8IYS5 282 aa50.02■■■■■ 5.6
NMB-201ENST00000360476 ABCC8Q09428 1581 aa49.99■■■■■ 5.59
NMB-201ENST00000360476 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.94■■■■■ 5.59
NMB-201ENST00000360476 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.85■■■■■ 5.57
NMB-201ENST00000360476 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.74■■■■■ 5.55
NMB-201ENST00000360476 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.66■■■■■ 5.54
NMB-201ENST00000360476 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.63■■■■■ 5.54
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NMB-201ENST00000360476 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.63■■■■■ 5.54
NMB-201ENST00000360476 CHD1O14646 1710 aa49.63■■■■■ 5.54
NMB-201ENST00000360476 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.57■■■■■ 5.53
NMB-201ENST00000360476 CUX1P39880 1505 aa49.48■■■■■ 5.51
NMB-201ENST00000360476 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.45■■■■■ 5.51
NMB-201ENST00000360476 ARHGEF11O15085 1522 aa49.42■■■■■ 5.5
NMB-201ENST00000360476 SOGA1O94964 1423 aa49.42■■■■■ 5.5
NMB-201ENST00000360476 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.34■■■■■ 5.49
NMB-201ENST00000360476 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.31■■■■■ 5.48
NMB-201ENST00000360476 WDR97A6NE52 1622 aa49.24■■■■■ 5.47
NMB-201ENST00000360476 FBLN2P98095 1184 aa49.21■■■■■ 5.47
NMB-201ENST00000360476 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.19■■■■■ 5.47
NMB-201ENST00000360476 PBRM1Q86U86 1689 aa49.04■■■■■ 5.44
NMB-201ENST00000360476 GRIN2BQ13224 1484 aa49■■■■■ 5.44
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NMB-201ENST00000360476 ARAP1Q96P48 1450 aa48.97■■■■■ 5.43
NMB-201ENST00000360476 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.93■■■■■ 5.42
NMB-201ENST00000360476 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.91■■■■■ 5.42
NMB-201ENST00000360476 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.89■■■■■ 5.42
NMB-201ENST00000360476 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.86■■■■■ 5.41
NMB-201ENST00000360476 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.86■■■■■ 5.41
NMB-201ENST00000360476 SYNJ1O43426 1573 aa48.85■■■■■ 5.41
NMB-201ENST00000360476 SYNJ2O15056 1496 aa48.83■■■■■ 5.41
NMB-201ENST00000360476 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.82■■■■■ 5.41
NMB-201ENST00000360476 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.76■■■■■ 5.4
NMB-201ENST00000360476 TOP2BQ02880 1626 aa48.69■■■■■ 5.39
NMB-201ENST00000360476 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.6■■■■■ 5.37
NMB-201ENST00000360476 ADAMTS12P58397 1594 aa48.51■■■■■ 5.36
NMB-201ENST00000360476 GRIN2AQ12879 1464 aa48.42■■■■■ 5.34
NMB-201ENST00000360476 CEP170Q5SW79 1584 aa48.33■■■■■ 5.33
NMB-201ENST00000360476 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.3■■■■■ 5.32
NMB-201ENST00000360476 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.26■■■■■ 5.32
NMB-201ENST00000360476 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.24■■■■■ 5.31
NMB-201ENST00000360476 NUP160Q12769 1436 aa48.24■■■■■ 5.31
NMB-201ENST00000360476 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.22■■■■■ 5.31
NMB-201ENST00000360476 SHROOM2Q13796 1616 aa48.1■■■■■ 5.29
NMB-201ENST00000360476 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.83■■■■■ 5.25
NMB-201ENST00000360476 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.73■■■■■ 5.23
NMB-201ENST00000360476 CUL7Q14999 1698 aa47.64■■■■■ 5.22
NMB-201ENST00000360476 JPH4Q96JJ6 628 aa47.62■■■■■ 5.21
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