Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRACR2AQ9BSW2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRACR2AQ9BSW2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2AQ9BSW2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2AQ9BSW2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2AQ9BSW2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2AQ9BSW2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRACR2AQ9BSW2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRACR2AQ9BSW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRACR2AQ9BSW2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CRACR2AQ9BSW2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRACR2AQ9BSW2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRACR2AQ9BSW2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRACR2AQ9BSW2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CRACR2AQ9BSW2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRACR2AQ9BSW2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms