Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C10orf55Q5SWW7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C10orf55Q5SWW7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C10orf55Q5SWW7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C10orf55Q5SWW7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms