RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519387.1

LY6K-203, Transcript of lymphocyte antigen 6 family member K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene LY6K, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6K-203ENST00000519387 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.09■■■■■ 8.65
LY6K-203ENST00000519387 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.97■■■■■ 7.51
LY6K-203ENST00000519387 ABCC9O60706 1549 aa61.92■■■■■ 7.5
LY6K-203ENST00000519387 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.95■■■■■ 7.03
LY6K-203ENST00000519387 NACADO15069 1562 aa58.54■■■■■ 6.96
LY6K-203ENST00000519387 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.42■■■■■ 6.94
LY6K-203ENST00000519387 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.93■■■■■ 6.86
LY6K-203ENST00000519387 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.7■■■■■ 6.83
LY6K-203ENST00000519387 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.69■■■■■ 6.83
LY6K-203ENST00000519387 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57.67■■■■■ 6.82
LY6K-203ENST00000519387 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.28■■■■■ 6.76
LY6K-203ENST00000519387 BICRAQ9NZM4 1560 aa57.2■■■■■ 6.75
LY6K-203ENST00000519387 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.02■■■■■ 6.72
LY6K-203ENST00000519387 SCRIBQ14160 1630 aa56.56■■■■■ 6.64
LY6K-203ENST00000519387 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.36■■■■■ 6.61
LY6K-203ENST00000519387 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.93■■■■■ 6.54
LY6K-203ENST00000519387 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.81■■■■■ 6.52
LY6K-203ENST00000519387 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.73■■■■■ 6.51
LY6K-203ENST00000519387 NCAPD3P42695 1498 aa54.01■■■■■ 6.24
LY6K-203ENST00000519387 SMARCA4P51532 1647 aa53.91■■■■■ 6.22
LY6K-203ENST00000519387 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.9■■■■■ 6.22
LY6K-203ENST00000519387 SMARCA2P51531 1590 aa53.76■■■■■ 6.2
LY6K-203ENST00000519387 HMGXB3Q12766 1538 aa53.64■■■■■ 6.18
LY6K-203ENST00000519387 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.64■■■■■ 6.18
LY6K-203ENST00000519387 ERCC6Q03468 1493 aa53.45■■■■■ 6.15
LY6K-203ENST00000519387 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.42■■■■■ 6.14
LY6K-203ENST00000519387 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.31■■■■■ 6.12
LY6K-203ENST00000519387 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.27■■■■■ 6.12
LY6K-203ENST00000519387 CUX2O14529 1486 aa53.25■■■■■ 6.11
LY6K-203ENST00000519387 NESP48681 1621 aa53.21■■■■■ 6.11
LY6K-203ENST00000519387 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa53.09■■■■■ 6.09
LY6K-203ENST00000519387 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.83■■■■■ 6.05
LY6K-203ENST00000519387 WIZO95785 1651 aa52.69■■■■■ 6.03
LY6K-203ENST00000519387 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.63■■■■■ 6.02
LY6K-203ENST00000519387 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.58■■■■■ 6.01
LY6K-203ENST00000519387 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.51■■■■■ 6
LY6K-203ENST00000519387 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.4■■■■■ 5.98
LY6K-203ENST00000519387 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.17■■■■■ 5.94
LY6K-203ENST00000519387 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.05■■■■■ 5.92
LY6K-203ENST00000519387 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.97■■■■■ 5.91
LY6K-203ENST00000519387 WDR62O43379 1518 aa51.91■■■■■ 5.9
LY6K-203ENST00000519387 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.89■■■■■ 5.9
LY6K-203ENST00000519387 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.84■■■■■ 5.89
LY6K-203ENST00000519387 CFTRP13569 1480 aa51.81■■■■■ 5.88
LY6K-203ENST00000519387 PRDM2Q13029 1718 aa51.42■■■■■ 5.82
LY6K-203ENST00000519387 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.4■■■■■ 5.82
LY6K-203ENST00000519387 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.39■■■■■ 5.82
LY6K-203ENST00000519387 TRIM41Q8WV44 630 aa50.94■■■■■ 5.75
LY6K-203ENST00000519387 TOPBP1Q92547 1522 aa50.87■■■■■ 5.73
LY6K-203ENST00000519387 OSCARQ8IYS5 282 aa50.87■■■■■ 5.73
LY6K-203ENST00000519387 IFT140Q96RY7 1462 aa50.83■■■■■ 5.73
LY6K-203ENST00000519387 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.77■■■■■ 5.72
LY6K-203ENST00000519387 ABCC8Q09428 1581 aa50.74■■■■■ 5.71
LY6K-203ENST00000519387 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.7■■■■■ 5.71
LY6K-203ENST00000519387 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.51■■■■■ 5.68
LY6K-203ENST00000519387 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.4■■■■■ 5.66
LY6K-203ENST00000519387 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.34■■■■■ 5.65
LY6K-203ENST00000519387 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.33■■■■■ 5.65
LY6K-203ENST00000519387 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.24■■■■■ 5.63
LY6K-203ENST00000519387 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.24■■■■■ 5.63
LY6K-203ENST00000519387 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.24■■■■■ 5.63
LY6K-203ENST00000519387 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.2■■■■■ 5.63
LY6K-203ENST00000519387 CHD1O14646 1710 aa50.17■■■■■ 5.62
LY6K-203ENST00000519387 SOGA1O94964 1423 aa50.14■■■■■ 5.62
LY6K-203ENST00000519387 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.08■■■■■ 5.61
LY6K-203ENST00000519387 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.08■■■■■ 5.61
LY6K-203ENST00000519387 ARHGEF11O15085 1522 aa50.06■■■■■ 5.6
LY6K-203ENST00000519387 FBLN2P98095 1184 aa50.04■■■■■ 5.6
LY6K-203ENST00000519387 CUX1P39880 1505 aa50.04■■■■■ 5.6
LY6K-203ENST00000519387 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.04■■■■■ 5.6
LY6K-203ENST00000519387 WDR97A6NE52 1622 aa49.87■■■■■ 5.57
LY6K-203ENST00000519387 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.82■■■■■ 5.57
LY6K-203ENST00000519387 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.72■■■■■ 5.55
LY6K-203ENST00000519387 GRIN2BQ13224 1484 aa49.68■■■■■ 5.54
LY6K-203ENST00000519387 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.65■■■■■ 5.54
LY6K-203ENST00000519387 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.64■■■■■ 5.54
LY6K-203ENST00000519387 PBRM1Q86U86 1689 aa49.58■■■■■ 5.53
LY6K-203ENST00000519387 ARAP1Q96P48 1450 aa49.57■■■■■ 5.53
LY6K-203ENST00000519387 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.54■■■■■ 5.52
LY6K-203ENST00000519387 SYNJ1O43426 1573 aa49.52■■■■■ 5.52
LY6K-203ENST00000519387 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.5■■■■■ 5.51
LY6K-203ENST00000519387 SYNJ2O15056 1496 aa49.49■■■■■ 5.51
LY6K-203ENST00000519387 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.47■■■■■ 5.51
LY6K-203ENST00000519387 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.42■■■■■ 5.5
LY6K-203ENST00000519387 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.31■■■■■ 5.48
LY6K-203ENST00000519387 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.28■■■■■ 5.48
LY6K-203ENST00000519387 TOP2BQ02880 1626 aa49.27■■■■■ 5.48
LY6K-203ENST00000519387 TRHP20396 242 aaPredicted RBP49.18■■■■■ 5.46
LY6K-203ENST00000519387 ADAMTS12P58397 1594 aa49.05■■■■■ 5.44
LY6K-203ENST00000519387 GRIN2AQ12879 1464 aa49.05■■■■■ 5.44
LY6K-203ENST00000519387 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.89■■■■■ 5.42
LY6K-203ENST00000519387 CEP170Q5SW79 1584 aa48.89■■■■■ 5.42
LY6K-203ENST00000519387 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.86■■■■■ 5.41
LY6K-203ENST00000519387 NUP160Q12769 1436 aa48.84■■■■■ 5.41
LY6K-203ENST00000519387 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.78■■■■■ 5.4
LY6K-203ENST00000519387 SHROOM2Q13796 1616 aa48.64■■■■■ 5.38
LY6K-203ENST00000519387 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.41■■■■■ 5.34
LY6K-203ENST00000519387 JPH4Q96JJ6 628 aa48.39■■■■■ 5.34
LY6K-203ENST00000519387 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.35■■■■■ 5.33
LY6K-203ENST00000519387 KIF27Q86VH2 1401 aa48.32■■■■■ 5.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms